More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4580 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  100 
 
 
443 aa  856    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  77.43 
 
 
424 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  77.43 
 
 
424 aa  587  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  52.51 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  51.88 
 
 
443 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  43.62 
 
 
476 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  45.07 
 
 
444 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  45.93 
 
 
464 aa  310  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2819  major facilitator superfamily MFS_1  49.28 
 
 
462 aa  298  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000630163  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 
429 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  29.29 
 
 
420 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  31.23 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 
459 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  26.07 
 
 
417 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  33 
 
 
432 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  28.08 
 
 
420 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 
410 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
463 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.38 
 
 
420 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.38 
 
 
420 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.38 
 
 
420 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.44 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.09 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.7 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.45 
 
 
420 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
494 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.54 
 
 
1833 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.73 
 
 
410 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  28.79 
 
 
415 aa  95.9  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  27.33 
 
 
420 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
432 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  27.06 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 
442 aa  94  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  29.5 
 
 
431 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  23.63 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  23.35 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.93 
 
 
474 aa  90.9  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  30.42 
 
 
415 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.74 
 
 
412 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  25.42 
 
 
410 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  23.14 
 
 
415 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  25.54 
 
 
410 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  23.14 
 
 
415 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
412 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  23.14 
 
 
415 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  23.14 
 
 
415 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  23.14 
 
 
415 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  25.18 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  23.14 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.17 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.17 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 
453 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  25.54 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  25.54 
 
 
410 aa  88.2  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  25.54 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  25.18 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  24.31 
 
 
426 aa  87.4  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  26.72 
 
 
1816 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
429 aa  87.4  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  27.11 
 
 
524 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.62 
 
 
436 aa  87.4  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0364  sugar transporter  25.66 
 
 
410 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  24.76 
 
 
405 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  25.06 
 
 
410 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  24.84 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.91 
 
 
445 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  22.22 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  26.9 
 
 
425 aa  84  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  22.66 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  26.49 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.54 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  22.47 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  22.65 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.6 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  21.62 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  21.6 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  26.83 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.57 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  27.01 
 
 
437 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  25.12 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 
432 aa  79.7  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
461 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  22.95 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  21.27 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  31.3 
 
 
321 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  25.35 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>