More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4562 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0697  Na+/solute symporter  74.64 
 
 		 580 aa  743    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4282  Na+/solute symporter  84.26 
 
 		 578 aa  827    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2141  Na+/solute symporter  92.59 
 
 		 580 aa  966    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.598944  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4053  Na+/solute symporter  84.26 
 
 		 578 aa  827    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4128  Na+/solute symporter  84.26 
 
 		 578 aa  827    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0931478  normal  0.469675 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4562  Na+/solute symporter  100 
 
 		 580 aa  1107    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0069  Na+/solute symporter  53.46 
 
 		 603 aa  508  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3375  Na+/solute symporter  53.59 
 
 		 580 aa  498  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3170  Na+/solute symporter  55.36 
 
 		 575 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0609078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5011  Na+/solute symporter  56.48 
 
 		 546 aa  482  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4497  Na+/solute symporter  57.09 
 
 		 546 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108837  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5280  Na+/solute symporter  52.95 
 
 		 573 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135801  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12120  predicted symporter  47.31 
 
 		 591 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.593677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1063  Na+/solute symporter  50 
 
 		 614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0264456  normal  0.304939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4131  Na+/solute symporter  47.76 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00890  predicted symporter  46.68 
 
 		 579 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2860  putative transmembrane transport protein  45.85 
 
 		 562 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00253612  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6322  SSS sodium solute transporter superfamily  56.2 
 
 		 499 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.950827  normal  0.754029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1373  Na+/solute symporter  54.31 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0355  Na+/solute symporter  63.24 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2131  Na+/solute symporter  53.68 
 
 		 492 aa  243  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1391  Na+/solute symporter  52.08 
 
 		 488 aa  241  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000394975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1155  Na+/solute symporter  68.04 
 
 		 495 aa  234  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  54.1 
 
 		 693 aa  203  6e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1397  SSS sodium solute transporter superfamily  31.18 
 
 		 665 aa  196  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1420  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.59 
 
 		 659 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2352  sodium/solute symporter family protein  30.6 
 
 		 584 aa  188  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0328342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1070  sodium/solute symporter family protein  30.98 
 
 		 584 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00394385  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1399  SSS sodium solute transporter superfamily  30.98 
 
 		 661 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00201971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1424  SSS sodium solute transporter superfamily  31.43 
 
 		 659 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2699  SSS sodium solute transporter superfamily  32.02 
 
 		 665 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000107835 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2096  Na+/solute symporter  32.43 
 
 		 590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.566252  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1517  SSS sodium solute transporter superfamily  30.93 
 
 		 664 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000116414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1373  SSS sodium solute transporter superfamily  30.39 
 
 		 662 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174329 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2840  SSS sodium solute transporter superfamily  30.06 
 
 		 661 aa  160  7e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2496  SSS sodium solute transporter superfamily  28.67 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2764  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.26 
 
 		 518 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1277  acetate permease  27.09 
 
 		 537 aa  157  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  28.47 
 
 		 666 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3675  hypothetical protein  27.71 
 
 		 554 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.834284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0449  SSS sodium solute transporter superfamily  27.9 
 
 		 576 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0465  SSS sodium solute transporter superfamily  27.9 
 
 		 576 aa  153  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25230  acetate permease  28.15 
 
 		 554 aa  153  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1760  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.84 
 
 		 530 aa  153  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.983666  normal  0.122546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1980  Na+/solute symporter  28.26 
 
 		 576 aa  152  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4010  acetate permease  26.85 
 
 		 557 aa  148  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.642464 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1379  acetate permease  28.23 
 
 		 574 aa  148  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.644113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6314  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.08 
 
 		 536 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267295  normal  0.199401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0556  acetate permease  27.9 
 
 		 572 aa  146  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  28.15 
 
 		 637 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0887  SSS sodium solute transporter superfamily  27.13 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0535  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.95 
 
 		 575 aa  144  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3879  acetate permease  28.19 
 
 		 576 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.262245  normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3142  acetate permease  27.71 
 
 		 576 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0219  SSS sodium solute transporter superfamily  28.55 
 
 		 552 aa  143  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2129  SSS sodium solute transporter superfamily protein  29.51 
 
 		 537 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1538  SSS sodium solute transporter superfamily protein  31.1 
 
 		 551 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.535704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1449  acetate permease  28.71 
 
 		 574 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.463386  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13340  SSS sodium solute transporter  28.2 
 
 		 556 aa  140  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0683463  normal  0.0921974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4284  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.03 
 
 		 541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.231008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  26.91 
 
 		 586 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3489  acetate permease  27.47 
 
 		 560 aa  135  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4055  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.03 
 
 		 541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.647451  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4130  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.03 
 
 		 541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  26.11 
 
 		 573 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  29.08 
 
 		 683 aa  130  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.03 
 
 		 672 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  26.39 
 
 		 568 aa  123  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  27.68 
 
 		 688 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0827  SSS sodium solute transporter superfamily  41.72 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  28.77 
 
 		 672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  27.38 
 
 		 729 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  29.11 
 
 		 671 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  29.11 
 
 		 671 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.11 
 
 		 671 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.11 
 
 		 671 aa  120  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  29.06 
 
 		 807 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  29.52 
 
 		 671 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  28.49 
 
 		 722 aa  120  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1891  acetate permease  25.21 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.45053  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  30.55 
 
 		 566 aa  120  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22350  acetate permease  25.54 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000316225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5174  SSS sodium solute transporter superfamily  26.78 
 
 		 525 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  27.91 
 
 		 681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.44 
 
 		 671 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  28.47 
 
 		 683 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  29.26 
 
 		 671 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  28.39 
 
 		 671 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  27.15 
 
 		 687 aa  117  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  30.35 
 
 		 719 aa  117  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  29.19 
 
 		 671 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  27.15 
 
 		 687 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  28.49 
 
 		 722 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.41 
 
 		 582 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  30.47 
 
 		 591 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0739  Na+/solute symporter  37.79 
 
 		 584 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000119238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  32.41 
 
 		 582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  28.57 
 
 		 671 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  29.19 
 
 		 592 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  32.1 
 
 		 582 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>