More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4429 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  100 
 
 
250 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  91.6 
 
 
249 aa  427  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  90.16 
 
 
254 aa  414  1e-115  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  90.16 
 
 
254 aa  414  1e-115  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  90.16 
 
 
254 aa  414  1e-115  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  84.81 
 
 
286 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  72.96 
 
 
271 aa  354  7e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  69.2 
 
 
252 aa  350  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  68.67 
 
 
248 aa  348  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.92 
 
 
273 aa  339  3e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  67.66 
 
 
236 aa  337  1e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.79 
 
 
243 aa  336  2e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  70.61 
 
 
406 aa  334  6e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.06 
 
 
252 aa  327  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.67 
 
 
242 aa  314  8e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  70.93 
 
 
231 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.6 
 
 
246 aa  305  5e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  63.68 
 
 
255 aa  302  4e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  60.4 
 
 
246 aa  300  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  62.93 
 
 
257 aa  295  3e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  59.83 
 
 
254 aa  291  8e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.05 
 
 
239 aa  269  3e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.94 
 
 
248 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.83 
 
 
244 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.23 
 
 
242 aa  261  8e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  3.87016e-06 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.71 
 
 
237 aa  261  8e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.31 
 
 
233 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  60.36 
 
 
239 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  56.89 
 
 
239 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  56.89 
 
 
239 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  56.89 
 
 
239 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.14 
 
 
236 aa  255  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.89 
 
 
236 aa  255  6e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  56 
 
 
246 aa  254  1e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  54.11 
 
 
233 aa  254  1e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.33 
 
 
243 aa  252  4e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  53.68 
 
 
233 aa  251  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.93 
 
 
240 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.02 
 
 
231 aa  251  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  55.31 
 
 
247 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.71 
 
 
238 aa  248  5e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 
236 aa  248  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 
238 aa  248  9e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  52.61 
 
 
241 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.7 
 
 
239 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.08 
 
 
258 aa  245  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  55.79 
 
 
239 aa  245  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.03 
 
 
244 aa  244  7e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.57 
 
 
235 aa  243  1e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  58.67 
 
 
233 aa  243  2e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  54.39 
 
 
235 aa  242  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  55.95 
 
 
237 aa  239  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 
242 aa  239  3e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  55.2 
 
 
234 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  52 
 
 
241 aa  236  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.82 
 
 
241 aa  235  5e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  54.91 
 
 
234 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  53.39 
 
 
251 aa  232  4e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.28 
 
 
236 aa  232  5e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
229 aa  232  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  50.21 
 
 
243 aa  231  6e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  52.68 
 
 
252 aa  230  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  49.79 
 
 
246 aa  231  1e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.49 
 
 
236 aa  225  5e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
239 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 
224 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 
230 aa  219  2e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  52.23 
 
 
229 aa  219  4e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 
228 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 
233 aa  216  3e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 
240 aa  214  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.11909e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 
270 aa  213  2e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 
231 aa  213  3e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
230 aa  212  5e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
230 aa  212  5e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 
230 aa  212  5e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.56 
 
 
241 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 
227 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 
227 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.5 
 
 
227 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  48.46 
 
 
231 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
236 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  3.68356e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  45.73 
 
 
237 aa  208  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 
224 aa  208  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 
224 aa  208  7e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  44.59 
 
 
227 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 
227 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 
224 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 
246 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 
224 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 
224 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 
224 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.34276e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 
229 aa  204  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  47.32 
 
 
224 aa  204  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 
228 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  46.43 
 
 
224 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  45.98 
 
 
230 aa  201  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.88235e-09  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  45.98 
 
 
224 aa  201  1e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  45.54 
 
 
223 aa  200  1e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 
223 aa  200  2e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>