More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4341 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2305  acyl-CoA synthetase  87.24 
 
 		 525 aa  945    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.918677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3835  AMP-dependent synthetase and ligase  67.19 
 
 		 532 aa  709    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3877  acyl-CoA synthetase  73.04 
 
 		 527 aa  733    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.133257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11768  acyl-CoA synthetase  66.54 
 
 		 532 aa  698    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365626 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3891  acyl-CoA synthetase  73.04 
 
 		 527 aa  733    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3965  acyl-CoA synthetase  73.04 
 
 		 527 aa  733    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.551618  normal  0.449613 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4341  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 526 aa  1073    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227386  normal  0.0335846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1549  acyl-CoA synthetase  52.54 
 
 		 512 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00257603  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4624  acyl-CoA synthetase  51.79 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4712  acyl-CoA synthetase  51.79 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5208  acyl-CoA synthetase  51.08 
 
 		 503 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13540  acyl-CoA synthetase  50.5 
 
 		 502 aa  463  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.55264e-46  hitchhiker  0.0000144188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5007  acyl-CoA synthetase  50.4 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223508  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3512  AMP-dependent synthetase and ligase  48.84 
 
 		 539 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.161778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3957  AMP-dependent synthetase and ligase  49.19 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3484  AMP-dependent synthetase and ligase  43.26 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.436889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8199  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 		 522 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.996066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5900  acyl-CoA synthetase  42.55 
 
 		 543 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1548  acyl-CoA synthetase  41.49 
 
 		 557 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0453148  normal  0.562815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5209  acyl-CoA synthetase  41.17 
 
 		 554 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0206  acyl-CoA synthetase  44.95 
 
 		 549 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0112  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 572 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 613 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000346834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0040  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 708 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1300  DitJ-like CoA ligase  29.77 
 
 		 547 aa  176  9e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2709  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.94 
 
 		 534 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.710965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2688  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.94 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.204709  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2757  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  28.6 
 
 		 538 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679806  normal  0.462941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4608  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  33.6 
 
 		 550 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  28.14 
 
 		 532 aa  156  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3258  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.67 
 
 		 545 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0832  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 551 aa  153  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 		 520 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1508  crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  29.25 
 
 		 535 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.65 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4035  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.63 
 
 		 517 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.948769  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7121  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 542 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3345  acid-CoA ligase family protein  27.99 
 
 		 547 aa  146  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3316  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.53 
 
 		 608 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.390941  hitchhiker  0.0000571786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0576  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  26.99 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 		 525 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3882  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 549 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  26.38 
 
 		 495 aa  143  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 509 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3639  AMP-dependent synthetase and ligase  27.37 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.917263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5072  long-chain-acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 		 605 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0947195  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 521 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 521 aa  140  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 508 aa  140  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 512 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3794  AMP-dependent synthetase and ligase  27.1 
 
 		 552 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  28.6 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2185  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.49 
 
 		 600 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00664297  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1832  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  30.85 
 
 		 537 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.603335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2673  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  27.82 
 
 		 518 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  27.62 
 
 		 517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  25.3 
 
 		 662 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1000  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.88 
 
 		 622 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.832439 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2453  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 544 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2066  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 527 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3444  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 598 aa  137  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7061  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.131857 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4237  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.04 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.168634 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4007  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.04 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.657785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4081  long-chain-acyl-CoA synthetase  28.04 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0876602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3540  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.32 
 
 		 596 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.498772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4939  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 517 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296689  normal  0.234323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1103  long-chain-acyl-CoA synthetase  30.57 
 
 		 630 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3226  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.67 
 
 		 517 aa  133  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3832  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 509 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 		 507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4281  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 		 524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.131424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 505 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1473  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1495  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 		 541 aa  131  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.82 
 
 		 524 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  26.39 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  25.13 
 
 		 544 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1645  long-chain-acyl-CoA synthetase  25.63 
 
 		 600 aa  130  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11230  long-chain-acyl-CoA synthetase  29.18 
 
 		 597 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0151554  normal  0.367156 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.2 
 
 		 514 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.114603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4510  long-chain-acyl-CoA synthetase  27.76 
 
 		 601 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 585 aa  130  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3769  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 568 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.43817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0075  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.54 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  24.7 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  28.42 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0078  putative crotonobetaine/carnitine-CoA ligase  25.54 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05877  bifunctional fatty acid transporter/acyl-CoA synthetase (FAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11360)  26.48 
 
 		 639 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.523538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  25.1 
 
 		 498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 		 518 aa  127  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1012  AMP-dependent synthetase and ligase  26.24 
 
 		 508 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>