More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4303 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
297 aa  584  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  82.55 
 
 
298 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  76.92 
 
 
299 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  76.92 
 
 
299 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  76.92 
 
 
299 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  65.79 
 
 
304 aa  363  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  43.42 
 
 
299 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  45 
 
 
313 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  47.1 
 
 
323 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  45.9 
 
 
326 aa  198  9e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  35.62 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  42.23 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  39.93 
 
 
300 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  37.1 
 
 
310 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  41.9 
 
 
311 aa  168  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  38.97 
 
 
300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  38.38 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  34.42 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  38.49 
 
 
310 aa  145  9e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  36.81 
 
 
312 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  34.33 
 
 
334 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  33.33 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  37.1 
 
 
331 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  38.38 
 
 
329 aa  135  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  32.67 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  36.69 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  34.11 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  33.75 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  34.44 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  41.63 
 
 
333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  32.45 
 
 
346 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 
319 aa  109  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  30.14 
 
 
293 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  30.71 
 
 
281 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  32.03 
 
 
280 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  25.97 
 
 
330 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  32.2 
 
 
280 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  34.89 
 
 
319 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  30.11 
 
 
281 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  27.67 
 
 
340 aa  99.8  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  30.74 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  29.43 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  26.69 
 
 
334 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  30.07 
 
 
306 aa  92  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  30.13 
 
 
304 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  30.56 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  29.14 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  29.47 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  30.58 
 
 
289 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  29.73 
 
 
310 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  31.51 
 
 
282 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  29.8 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  28.96 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  27.33 
 
 
302 aa  87  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  29.82 
 
 
282 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  29.82 
 
 
282 aa  87  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  40 
 
 
282 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  25.93 
 
 
302 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  29.57 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  30.77 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  32.92 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  29.47 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  29.47 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  24.32 
 
 
324 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  29.12 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  29.35 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  30.39 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  30.34 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  23.23 
 
 
324 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  25.42 
 
 
306 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  25.5 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  28.03 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  30.31 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  35.24 
 
 
318 aa  79  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  35.78 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  30.66 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  28.38 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  35.78 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  26.83 
 
 
274 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  35.78 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  35.92 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  30.66 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  30.56 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  28.03 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  27 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  37.14 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  37.14 
 
 
284 aa  77  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  26.19 
 
 
290 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  26.64 
 
 
312 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  25.16 
 
 
306 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  25.08 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  26.18 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  35.24 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  35.24 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  35.24 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  35.24 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  35.24 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  35.24 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  35.24 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  35.24 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>