More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4246 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
288 aa  594  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  94.1 
 
 
288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  89.9 
 
 
287 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  89.9 
 
 
287 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  89.55 
 
 
287 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  83.28 
 
 
295 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  60.28 
 
 
293 aa  372  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  43.42 
 
 
287 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  42.25 
 
 
292 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 
304 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
299 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  37.16 
 
 
316 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  37.91 
 
 
299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
288 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  33.68 
 
 
301 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
350 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
288 aa  118  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
298 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
281 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 
273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
295 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  30.29 
 
 
291 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
279 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
288 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
299 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
299 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
299 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
279 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  30.08 
 
 
275 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
311 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
290 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
289 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
295 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
284 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
309 aa  102  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 
288 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 
350 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
314 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  32.46 
 
 
289 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  31.48 
 
 
276 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
340 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
340 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
340 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.82 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.92 
 
 
369 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 
277 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
333 aa  96.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
291 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  29.04 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
284 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  31.37 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 
282 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
276 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  28.27 
 
 
302 aa  95.9  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  30.77 
 
 
286 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
301 aa  95.5  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
275 aa  95.5  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
293 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
285 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
293 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
277 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
291 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
291 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  31.25 
 
 
271 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
277 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.33 
 
 
291 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
291 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
340 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  26.8 
 
 
345 aa  92.8  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 
280 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
286 aa  92.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 
298 aa  92.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
340 aa  92.4  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
296 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
285 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  29.5 
 
 
278 aa  92.4  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.73 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>