More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4121 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
457 aa  928    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  63.27 
 
 
452 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  60.84 
 
 
472 aa  584  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  60.18 
 
 
452 aa  552  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  54.87 
 
 
454 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  53.32 
 
 
454 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  55.81 
 
 
473 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  54.08 
 
 
452 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  53.19 
 
 
467 aa  482  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  54.38 
 
 
455 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  53.42 
 
 
455 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  52.98 
 
 
455 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  53.29 
 
 
477 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  52.32 
 
 
468 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  52.09 
 
 
470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  51.35 
 
 
470 aa  468  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  50.99 
 
 
454 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  52.93 
 
 
452 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  50.11 
 
 
452 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  53.47 
 
 
459 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  49.89 
 
 
452 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  53.47 
 
 
472 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  53.24 
 
 
603 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  53.24 
 
 
589 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  53.24 
 
 
472 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  53.47 
 
 
472 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  53.47 
 
 
472 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  50.22 
 
 
454 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  50.66 
 
 
455 aa  460  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  50.22 
 
 
454 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  50.99 
 
 
452 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  50.55 
 
 
452 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  50.22 
 
 
455 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  50.44 
 
 
452 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  48.55 
 
 
453 aa  448  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  49.23 
 
 
461 aa  443  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  50.11 
 
 
453 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  50.68 
 
 
452 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  51.65 
 
 
468 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  51.76 
 
 
454 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  51.76 
 
 
454 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  50.68 
 
 
453 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  49.2 
 
 
452 aa  425  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  50 
 
 
454 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 
454 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  50.67 
 
 
454 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  48.81 
 
 
461 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  46.48 
 
 
460 aa  389  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  45.25 
 
 
451 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  48.04 
 
 
460 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  47.39 
 
 
460 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  44.68 
 
 
476 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  46.32 
 
 
460 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  40.94 
 
 
467 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  41.05 
 
 
468 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  40.85 
 
 
468 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  40.98 
 
 
530 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.45 
 
 
464 aa  338  9e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  41.28 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  41.44 
 
 
469 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  42.71 
 
 
465 aa  335  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  41.34 
 
 
524 aa  333  5e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.51 
 
 
541 aa  332  7.000000000000001e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  40.21 
 
 
467 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  40.94 
 
 
544 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  41.3 
 
 
462 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  39.14 
 
 
525 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  41.11 
 
 
535 aa  329  6e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  41.72 
 
 
469 aa  326  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  39.27 
 
 
522 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0925  beta-lactamase domain protein  40.39 
 
 
464 aa  326  7e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.13 
 
 
536 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  40.98 
 
 
468 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.62 
 
 
525 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  40.21 
 
 
467 aa  323  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.12 
 
 
543 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  42.03 
 
 
462 aa  322  8e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  40.51 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  38.64 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  39.62 
 
 
464 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.59 
 
 
474 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.29 
 
 
465 aa  316  5e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  38.97 
 
 
465 aa  316  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
536 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.53 
 
 
466 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  39.34 
 
 
466 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.14 
 
 
540 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  36.42 
 
 
570 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  38.48 
 
 
536 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0828  beta-lactamase domain-containing protein  41.03 
 
 
476 aa  299  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0969398  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0768  beta-lactamase domain protein  39.55 
 
 
451 aa  299  8e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000108746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0992  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.43 
 
 
470 aa  298  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.93 
 
 
467 aa  298  2e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  37.96 
 
 
536 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  40.04 
 
 
468 aa  293  4e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.465693 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01524  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.37 
 
 
455 aa  292  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  36.93 
 
 
467 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  36.06 
 
 
465 aa  290  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3327  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.33 
 
 
481 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0851  beta-lactamase domain protein  36.78 
 
 
464 aa  289  8e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>