More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3970 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3970  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.000828304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2611  oxidoreductase domain-containing protein  79.38 
 
 		 320 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  56.35 
 
 		 332 aa  373  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  55.38 
 
 		 345 aa  344  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  45.48 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  34.89 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  35.58 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  36.02 
 
 		 332 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  32.92 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0215692 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08642  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  30.05 
 
 		 408 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  30.93 
 
 		 334 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  31.99 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 337 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  31.56 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  33.75 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  30.98 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03524  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04870)  26.77 
 
 		 416 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00618611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  38.81 
 
 		 327 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  28.99 
 
 		 331 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  32.53 
 
 		 343 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  30.15 
 
 		 667 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  28.7 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  32.42 
 
 		 344 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  30.12 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  27.76 
 
 		 667 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 667 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  37.99 
 
 		 326 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  31.12 
 
 		 328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2291  NAD binding oxidoreductase  29.69 
 
 		 328 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0377334  hitchhiker  0.000000256259 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  35.14 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  31.54 
 
 		 667 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.35 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  33.2 
 
 		 665 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  36.2 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  29.91 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  24.83 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  35.22 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  35.46 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  32.76 
 
 		 329 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  26.96 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4698  oxidoreductase domain protein  29.97 
 
 		 331 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.489828  normal  0.94732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  28.77 
 
 		 332 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.35 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  30.42 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.27 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.27 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.05 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  23.84 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4534  oxidoreductase domain protein  31.79 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.221748  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  32.48 
 
 		 329 aa  99.4  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  29.35 
 
 		 323 aa  99  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.56 
 
 		 670 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  30.91 
 
 		 357 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  33.05 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  26.63 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  28.66 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  27.46 
 
 		 328 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  29.72 
 
 		 356 aa  95.9  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 331 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  34.5 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  29.86 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  25.17 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  32.14 
 
 		 342 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  26.09 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  32.57 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  27.41 
 
 		 338 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  27.82 
 
 		 327 aa  93.2  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  28.77 
 
 		 323 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  28.64 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  33.64 
 
 		 354 aa  92.8  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  33.48 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3608  oxidoreductase domain-containing protein  33.04 
 
 		 340 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  33.01 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  30.23 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  26.51 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1266  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 336 aa  90.9  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.051874  hitchhiker  0.000127029 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  23.6 
 
 		 319 aa  89.7  6e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.33 
 
 		 327 aa  89.4  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5051  oxidoreductase domain protein  28.33 
 
 		 405 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.843683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  28.92 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  24.52 
 
 		 401 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  26.87 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  27.51 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4116  oxidoreductase domain protein  31.73 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0583  oxidoreductase domain-containing protein  27.54 
 
 		 396 aa  87.4  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0178455  normal  0.601726 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3447  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 435 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  32.54 
 
 		 358 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1646  dehydrogenase related protein  24.16 
 
 		 324 aa  86.3  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4998  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 		 405 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  37.91 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  27.44 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0446  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.74 
 
 		 319 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.128623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  29.63 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  32.47 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>