More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3924 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 225 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  89.78 
 
 		 224 aa  356  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  82.1 
 
 		 226 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  82.1 
 
 		 226 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  82.1 
 
 		 226 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  76.99 
 
 		 223 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  66.51 
 
 		 234 aa  254  8e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  67.89 
 
 		 220 aa  244  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  51.38 
 
 		 203 aa  194  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  47.69 
 
 		 204 aa  177  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  40.45 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  42.02 
 
 		 207 aa  121  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  39.27 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  43.92 
 
 		 210 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  41.12 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  37.67 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  38 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  35.62 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  38.62 
 
 		 232 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  31.15 
 
 		 281 aa  104  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.48 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 209 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  40.53 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  39.36 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 207 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  40.53 
 
 		 210 aa  96.3  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  36.57 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 212 aa  93.6  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  28.51 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.89 
 
 		 208 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 202 aa  92  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 214 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.6 
 
 		 382 aa  89.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 370 aa  89.4  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 225 aa  89  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.84 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 208 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 227 aa  84.7  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  30.9 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  32.97 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.4 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  35.54 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 448 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.09 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  42.74 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  33.53 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.27 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.21 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 448 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  33.73 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  38.82 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.7 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>