More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3912 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 86 aa  166  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  91.86 
 
 		 86 aa  154  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  82.56 
 
 		 86 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  82.56 
 
 		 86 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  82.56 
 
 		 86 aa  138  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  81.4 
 
 		 86 aa  129  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  76.74 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  74.42 
 
 		 86 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  75.31 
 
 		 86 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  74.07 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  72.09 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  69.14 
 
 		 86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  71.08 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  74.67 
 
 		 86 aa  107  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  71.6 
 
 		 88 aa  105  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  66.28 
 
 		 92 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  71.6 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  69.88 
 
 		 86 aa  104  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  69.88 
 
 		 86 aa  103  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  71.6 
 
 		 86 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  70.37 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  63.95 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  64.2 
 
 		 86 aa  102  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  67.44 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  71.08 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  67.9 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  68.83 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  71.6 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  67.9 
 
 		 90 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  67.09 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  68.67 
 
 		 86 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  62.79 
 
 		 88 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  67.44 
 
 		 86 aa  93.6  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  62.96 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  62.65 
 
 		 86 aa  90.5  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  60.76 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  60.49 
 
 		 87 aa  89.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  67.5 
 
 		 88 aa  86.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  66.27 
 
 		 88 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  55 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  55 
 
 		 87 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 89 aa  82  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  62.65 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 89 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  60.49 
 
 		 172 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  54.32 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  45.88 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  49.41 
 
 		 89 aa  70.5  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  44.19 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  51.85 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1184  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  50.62 
 
 		 85 aa  67  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 87 aa  65.5  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  45 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0792  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000429038  normal  0.540603 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3590  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000579115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3462  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000449993  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0739  30S ribosomal protein S20  41.94 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  41.18 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18881  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1018  30S ribosomal protein S20  45.16 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.859687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0696  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000207001  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  45 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>