242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3904 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  100 
 
 
393 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  100 
 
 
393 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  100 
 
 
393 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  100 
 
 
393 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  71.76 
 
 
393 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  71.76 
 
 
393 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  71.76 
 
 
393 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  71.76 
 
 
393 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  71.76 
 
 
393 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  71.76 
 
 
393 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  71.76 
 
 
393 aa  551  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  41.13 
 
 
399 aa  246  6e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  41.13 
 
 
399 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  41.13 
 
 
399 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  40.21 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  35.71 
 
 
395 aa  159  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  35.71 
 
 
364 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  35.71 
 
 
364 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  37.5 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  29.34 
 
 
373 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  34.63 
 
 
344 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  37.37 
 
 
367 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  27.47 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  35.52 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  25.61 
 
 
361 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  25.61 
 
 
361 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  25.61 
 
 
361 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  25.61 
 
 
361 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  25.61 
 
 
361 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  25.61 
 
 
361 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  25.61 
 
 
361 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  28.53 
 
 
388 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  28.53 
 
 
388 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  28.53 
 
 
388 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  23.36 
 
 
384 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  25.98 
 
 
372 aa  106  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  23.65 
 
 
370 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  28.52 
 
 
519 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  26.86 
 
 
336 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  27.82 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.48 
 
 
374 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.48 
 
 
374 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  23.22 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  24.4 
 
 
308 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  36.03 
 
 
141 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  32.2 
 
 
402 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.17 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  27.25 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  27.25 
 
 
297 aa  55.8  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.87 
 
 
300 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.87 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  22.62 
 
 
290 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  23.66 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.87 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  26.42 
 
 
310 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2246  integrase family protein  20.18 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  32 
 
 
403 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.67 
 
 
295 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  23.1 
 
 
290 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  25.5 
 
 
299 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  21.7 
 
 
290 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  27.91 
 
 
370 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.34 
 
 
369 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  33.33 
 
 
391 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1288  integrase family protein  20.18 
 
 
382 aa  53.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00250501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  19.88 
 
 
337 aa  53.5  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.12 
 
 
312 aa  53.5  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.33 
 
 
435 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.71 
 
 
369 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.67 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  24.87 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  26.01 
 
 
314 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.21 
 
 
302 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 
309 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  25.22 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  25.22 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  25.22 
 
 
324 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  32.18 
 
 
300 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  28.3 
 
 
391 aa  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  34.97 
 
 
320 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  22.29 
 
 
329 aa  51.6  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.57 
 
 
305 aa  51.6  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  25.14 
 
 
317 aa  51.2  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.74 
 
 
450 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  34.72 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.37 
 
 
310 aa  50.4  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  23.57 
 
 
309 aa  50.8  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  44.26 
 
 
443 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.01 
 
 
310 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  27.46 
 
 
349 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  27.46 
 
 
349 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  27.46 
 
 
349 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  25.39 
 
 
256 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.63 
 
 
322 aa  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  27.05 
 
 
328 aa  50.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  38.46 
 
 
384 aa  49.7  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  29.83 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1383  integrase family protein  21.56 
 
 
299 aa  49.7  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00162011  normal  0.640047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  24.43 
 
 
293 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  27.75 
 
 
469 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>