250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3837 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  100 
 
 
343 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  90.67 
 
 
343 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  89.63 
 
 
347 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  89.63 
 
 
347 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  89.63 
 
 
347 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  86.01 
 
 
343 aa  569  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  70.52 
 
 
344 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  68.33 
 
 
340 aa  454  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  68.8 
 
 
341 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  67.34 
 
 
344 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  60.24 
 
 
339 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  60.53 
 
 
339 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.65 
 
 
340 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  58.41 
 
 
340 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.48 
 
 
340 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  58.7 
 
 
351 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  58.16 
 
 
340 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.97 
 
 
337 aa  362  6e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.1 
 
 
337 aa  361  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  55.92 
 
 
343 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.88 
 
 
340 aa  350  2e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  55.19 
 
 
337 aa  348  7e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.07 
 
 
339 aa  345  5e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  56.56 
 
 
339 aa  342  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.1 
 
 
337 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  52.82 
 
 
343 aa  333  4e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.68 
 
 
341 aa  322  8e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  52.63 
 
 
337 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.23 
 
 
346 aa  320  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.42 
 
 
351 aa  320  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.74 
 
 
346 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.86 
 
 
350 aa  310  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  50.29 
 
 
337 aa  310  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  51.47 
 
 
340 aa  308  9e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  50.29 
 
 
337 aa  293  2e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  43.18 
 
 
336 aa  259  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  41.88 
 
 
345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  39.95 
 
 
372 aa  230  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  33.73 
 
 
344 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.76 
 
 
347 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.21 
 
 
344 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.95 
 
 
344 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.66 
 
 
343 aa  189  8e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.22 
 
 
345 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.73 
 
 
343 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.93 
 
 
347 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  29.65 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.82 
 
 
337 aa  177  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.09 
 
 
351 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  29.36 
 
 
339 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  30.06 
 
 
344 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.27 
 
 
343 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.38 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.36 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  35.26 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.75 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1034  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.08 
 
 
348 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00468429  hitchhiker  0.0007913 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.47 
 
 
343 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.84 
 
 
343 aa  169  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.77 
 
 
345 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.03 
 
 
343 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.38 
 
 
344 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  32.54 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.85 
 
 
354 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.22 
 
 
343 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4485  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.47 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4466  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.47 
 
 
353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.769802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.94 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4330  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.29 
 
 
355 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.22068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.45 
 
 
345 aa  161  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  32.25 
 
 
364 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  33.44 
 
 
348 aa  159  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.32 
 
 
363 aa  159  7e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.38 
 
 
350 aa  158  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1026  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.37 
 
 
354 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  29.54 
 
 
343 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  30.9 
 
 
360 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  29.45 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
338 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3507  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.36 
 
 
343 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0868  negative regulator of class I heat shock protein  29.67 
 
 
342 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
338 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2127  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.31 
 
 
373 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.97 
 
 
357 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  28.83 
 
 
338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  33.15 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  30.73 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
338 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  29.14 
 
 
338 aa  153  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.23 
 
 
365 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  32.6 
 
 
365 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.56 
 
 
351 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2293  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.67 
 
 
340 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.627899  normal  0.0361411 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2667  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.67 
 
 
340 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0187  heat-inducible transcription repressor  32.36 
 
 
362 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1489  negative regulator of class I heat shock protein  31.64 
 
 
357 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>