More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3807 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  280  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  86.01 
 
 
146 aa  245  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  70.92 
 
 
147 aa  205  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  71.22 
 
 
163 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  74.05 
 
 
155 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  74.05 
 
 
155 aa  184  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  74.05 
 
 
155 aa  184  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  37.12 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  33.33 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
208 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  33.81 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  47.3 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  42.31 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
193 aa  62  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  36.11 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
155 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  34.88 
 
 
171 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  33.83 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
163 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  32.84 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
153 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
156 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  32.56 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 
152 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  30.11 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
162 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  30.3 
 
 
144 aa  52.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  41.58 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
144 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 
140 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 
161 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  32.56 
 
 
153 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
172 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  30.15 
 
 
149 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  42.86 
 
 
153 aa  50.8  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 
201 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
174 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0797  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  28 
 
 
141 aa  48.1  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>