More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3761 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  75.14 
 
 
529 aa  802    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 
527 aa  1047    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  80.65 
 
 
525 aa  827    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  80.65 
 
 
525 aa  827    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  89.37 
 
 
527 aa  935    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  80.65 
 
 
525 aa  827    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  58.17 
 
 
528 aa  555  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  55.51 
 
 
532 aa  522  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  56.46 
 
 
518 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.81 
 
 
521 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  57.03 
 
 
524 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  53.42 
 
 
572 aa  501  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.64 
 
 
531 aa  492  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  55.32 
 
 
545 aa  478  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.05 
 
 
540 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  51.43 
 
 
521 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  51.13 
 
 
520 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  49.26 
 
 
550 aa  425  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  51.36 
 
 
534 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.94 
 
 
533 aa  356  6.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  37.34 
 
 
556 aa  344  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.42 
 
 
568 aa  338  9.999999999999999e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  36.59 
 
 
584 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.58 
 
 
557 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  36.56 
 
 
583 aa  332  1e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  34.71 
 
 
563 aa  330  4e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  35.96 
 
 
552 aa  325  8.000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  38.19 
 
 
531 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  34.72 
 
 
554 aa  319  6e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.81 
 
 
531 aa  318  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  37.82 
 
 
531 aa  316  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  36.07 
 
 
538 aa  306  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.12 
 
 
579 aa  301  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.8 
 
 
534 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  33.27 
 
 
559 aa  299  7e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.31 
 
 
565 aa  295  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  29.65 
 
 
586 aa  286  8e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  39.96 
 
 
546 aa  282  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.31 
 
 
536 aa  274  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.1 
 
 
535 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  37.38 
 
 
527 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.43 
 
 
564 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  34.17 
 
 
534 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  32.8 
 
 
534 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  33.53 
 
 
502 aa  253  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  36.05 
 
 
532 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  35.92 
 
 
531 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.12 
 
 
467 aa  229  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.3 
 
 
520 aa  228  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  35.25 
 
 
532 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  35.73 
 
 
470 aa  226  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.02 
 
 
510 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  33.49 
 
 
465 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  34.75 
 
 
517 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  36.15 
 
 
520 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.04 
 
 
516 aa  211  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.2 
 
 
516 aa  207  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.09 
 
 
523 aa  207  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  34.65 
 
 
513 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  29.76 
 
 
484 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  28.86 
 
 
484 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  28.86 
 
 
484 aa  179  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  28.43 
 
 
484 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.66 
 
 
484 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  28.66 
 
 
484 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  28.66 
 
 
484 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  28.66 
 
 
484 aa  178  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  28.66 
 
 
484 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  26.2 
 
 
554 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.58 
 
 
457 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  27.94 
 
 
451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.89 
 
 
477 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.47 
 
 
469 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.27 
 
 
469 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1149  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.04 
 
 
467 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.930112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.89 
 
 
462 aa  151  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3821  FAD linked oxidase-like  29.96 
 
 
469 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303246  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 
469 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.45 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.24 
 
 
469 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0251  FAD linked oxidase-like  29.96 
 
 
452 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.84 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.25 
 
 
472 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  38.35 
 
 
572 aa  145  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3317  FAD linked oxidase domain protein  31.61 
 
 
453 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1292  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  30.23 
 
 
469 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  28.25 
 
 
471 aa  144  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  27.01 
 
 
470 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  27.01 
 
 
470 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.34 
 
 
474 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.8 
 
 
470 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  26.8 
 
 
470 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  29.57 
 
 
454 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  25.77 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  27.73 
 
 
471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.8 
 
 
470 aa  140  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0069  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 
473 aa  140  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.881498  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  30.44 
 
 
474 aa  140  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3295  putative glycolate oxidase subunit  30 
 
 
469 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3341  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  30 
 
 
469 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>