120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3760 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  76.04 
 
 		 191 aa  283  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  70.98 
 
 		 193 aa  261  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  70.98 
 
 		 193 aa  261  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  70.98 
 
 		 193 aa  261  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  53.68 
 
 		 189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  43.46 
 
 		 197 aa  141  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 279 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  38.07 
 
 		 211 aa  114  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  38.31 
 
 		 200 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3334  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  29.38 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1592  regulatory protein TetR  48.84 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  26.81 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 225 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  36.73 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  55.26 
 
 		 233 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  27.56 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  41.03 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  20.59 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  37.78 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  42  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 199 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 195 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 219 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 248 aa  42  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 201 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 194 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 221 aa  41.6  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  31.63 
 
 		 218 aa  42  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>