100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3709 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  98.16 
 
 
331 aa  634    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  98.47 
 
 
331 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  96.93 
 
 
331 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  96.43 
 
 
308 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  62.21 
 
 
307 aa  353  2e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  50.16 
 
 
322 aa  285  9e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.26 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  37.46 
 
 
319 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  38.36 
 
 
665 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  38.36 
 
 
665 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  38.36 
 
 
665 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  31.63 
 
 
681 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  35.97 
 
 
718 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  36.98 
 
 
692 aa  152  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  35.76 
 
 
651 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  34.72 
 
 
661 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  36.69 
 
 
722 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.93 
 
 
675 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  36.73 
 
 
672 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  33.73 
 
 
719 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 
718 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  38.76 
 
 
676 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  36.75 
 
 
736 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  34.38 
 
 
678 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.39 
 
 
654 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  35.88 
 
 
632 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  32.85 
 
 
687 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  34.47 
 
 
739 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  32.54 
 
 
686 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  34.35 
 
 
697 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.98 
 
 
731 aa  133  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  34.18 
 
 
671 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  33.22 
 
 
752 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  33.55 
 
 
651 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  33.22 
 
 
671 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  33.44 
 
 
679 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  30.52 
 
 
691 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  32.51 
 
 
664 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  33.22 
 
 
708 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  29.51 
 
 
322 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  31.51 
 
 
328 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  28.26 
 
 
310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  30.86 
 
 
708 aa  116  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  32.71 
 
 
711 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  29.21 
 
 
631 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  27.47 
 
 
322 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.64 
 
 
613 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.34 
 
 
683 aa  106  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  31.94 
 
 
687 aa  97.1  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  30.34 
 
 
646 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  29.89 
 
 
641 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  29.89 
 
 
641 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  27.59 
 
 
394 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  29 
 
 
637 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  29.78 
 
 
642 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  28.71 
 
 
354 aa  89.4  7e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.62 
 
 
326 aa  89.4  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  22.91 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  30 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  29.92 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  25 
 
 
270 aa  63.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  24.69 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.07 
 
 
309 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  26.92 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  27.68 
 
 
651 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  25.12 
 
 
332 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  25.65 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.01 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  27.27 
 
 
298 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  22.88 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  22.88 
 
 
277 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  26.53 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  23.1 
 
 
274 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  28.14 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  25.26 
 
 
387 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  23.51 
 
 
265 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  27.51 
 
 
264 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  22.83 
 
 
277 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5241  membrane protein-like protein  24.68 
 
 
300 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0567111  normal  0.512081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  22.73 
 
 
277 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5775  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.5 
 
 
283 aa  52.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  23.86 
 
 
296 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6358  hypothetical protein  27.62 
 
 
328 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  27.4 
 
 
317 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  24.62 
 
 
294 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  24.73 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2642  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  28.42 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3766  cytochrome c oxidase caa3 type assembly factor CtaG  29.51 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  26.63 
 
 
300 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4058  hypothetical protein  24.32 
 
 
301 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1197  hypothetical protein  22.79 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3987  hypothetical protein  26.78 
 
 
301 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  22.85 
 
 
290 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>