78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3692 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 
642 aa  1242    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  93.46 
 
 
641 aa  1117    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  88.94 
 
 
646 aa  1076    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  93.46 
 
 
641 aa  1117    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  89.66 
 
 
637 aa  1064    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  59.84 
 
 
665 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  60 
 
 
665 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  59.84 
 
 
665 aa  629  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  56.85 
 
 
676 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  58.27 
 
 
672 aa  588  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  44.84 
 
 
651 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  46.13 
 
 
687 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  43.57 
 
 
675 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  41.09 
 
 
686 aa  359  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  38.25 
 
 
678 aa  330  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  36.47 
 
 
692 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  35.68 
 
 
664 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  36.04 
 
 
681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.63 
 
 
731 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  36.71 
 
 
651 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  34.18 
 
 
691 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  38.05 
 
 
632 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  34.47 
 
 
679 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  36.36 
 
 
739 aa  257  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  33.85 
 
 
718 aa  253  7e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  35.34 
 
 
718 aa  248  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  38.68 
 
 
671 aa  247  6e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  34.74 
 
 
708 aa  238  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  32.33 
 
 
736 aa  228  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  31.03 
 
 
687 aa  224  3e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  33.39 
 
 
631 aa  220  7.999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  32.42 
 
 
752 aa  219  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  31.5 
 
 
697 aa  217  5e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  31.5 
 
 
708 aa  211  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.1 
 
 
613 aa  211  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  32.75 
 
 
719 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  40.43 
 
 
661 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.13 
 
 
683 aa  199  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  32.12 
 
 
711 aa  186  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  38.07 
 
 
651 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.31 
 
 
654 aa  174  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  29.73 
 
 
671 aa  157  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  30.37 
 
 
653 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  36.36 
 
 
319 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.45 
 
 
319 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  31.75 
 
 
322 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  31.91 
 
 
328 aa  120  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  30.69 
 
 
310 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  31.62 
 
 
322 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  29.96 
 
 
308 aa  94  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  29.85 
 
 
331 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  29.85 
 
 
331 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  29.96 
 
 
326 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  29.96 
 
 
331 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  28.52 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.5 
 
 
604 aa  73.9  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  30.74 
 
 
322 aa  70.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  27.57 
 
 
254 aa  69.7  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.81 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  27.17 
 
 
354 aa  67  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  36.84 
 
 
273 aa  66.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  31.25 
 
 
343 aa  66.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  27.76 
 
 
343 aa  64.7  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  26.74 
 
 
307 aa  63.9  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  24.56 
 
 
327 aa  63.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  31.97 
 
 
339 aa  58.9  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  25.28 
 
 
274 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  25.28 
 
 
265 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  25.28 
 
 
277 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  32.62 
 
 
559 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  31.25 
 
 
387 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  24.72 
 
 
277 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  24.72 
 
 
277 aa  49.7  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 
290 aa  47.8  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  24.16 
 
 
277 aa  47.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.29 
 
 
544 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  27.43 
 
 
528 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.19 
 
 
246 aa  44.3  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>