More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3536 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 359 aa  711    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  87.74 
 
 		 359 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  79.67 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  79.67 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  79.67 
 
 		 359 aa  528  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  67.61 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  53.54 
 
 		 362 aa  318  9e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.8 
 
 		 361 aa  305  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  48.06 
 
 		 356 aa  302  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  47.53 
 
 		 376 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  50.32 
 
 		 353 aa  280  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  44.96 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  48.27 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  48.48 
 
 		 367 aa  266  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  46.88 
 
 		 357 aa  262  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  48.27 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  45.32 
 
 		 358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  49.03 
 
 		 358 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  46.36 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  45.9 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  47.42 
 
 		 361 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  46.67 
 
 		 356 aa  245  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  49.45 
 
 		 634 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  40.96 
 
 		 365 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  47.96 
 
 		 377 aa  239  6.999999999999999e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  43.66 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.06 
 
 		 362 aa  226  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  40.56 
 
 		 364 aa  225  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  40.57 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  44.23 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  45.45 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  39.11 
 
 		 364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.18 
 
 		 369 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  43.62 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  39.69 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  39.69 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  40.62 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  41.94 
 
 		 362 aa  200  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.5 
 
 		 373 aa  196  5.000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.63 
 
 		 377 aa  196  6e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  38.41 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 		 1155 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  41.1 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  43.53 
 
 		 362 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  38.39 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  41.59 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  41.59 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  41.59 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  36.13 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  36.56 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  30.51 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  29.91 
 
 		 324 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  31.41 
 
 		 323 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.73 
 
 		 382 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  25.47 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  30.95 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  30.27 
 
 		 332 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  28.78 
 
 		 368 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.79 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  30.42 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  29.82 
 
 		 330 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  29.97 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.16 
 
 		 361 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  28.22 
 
 		 324 aa  112  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  31.65 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.87 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  28.98 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  33.21 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  31.06 
 
 		 324 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  28.98 
 
 		 317 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  29.21 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  32.67 
 
 		 323 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  28.9 
 
 		 322 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  29.29 
 
 		 332 aa  109  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  29.36 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.01 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  32.31 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  30.98 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.55 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  28 
 
 		 321 aa  107  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  28.72 
 
 		 331 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.73 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  30.66 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  37.82 
 
 		 304 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  27.65 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  32.18 
 
 		 346 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  31.03 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  28.47 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.27 
 
 		 345 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.13 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  28.39 
 
 		 327 aa  103  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  30.29 
 
 		 317 aa  102  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  30.94 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  29.9 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  29.81 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  29.9 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>