More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3489 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  95.81 
 
 
451 aa  817    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  76.74 
 
 
450 aa  698    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  73.02 
 
 
446 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  72.16 
 
 
448 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  82.56 
 
 
444 aa  718    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  82.56 
 
 
444 aa  718    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  869    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  82.33 
 
 
444 aa  716    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  67.37 
 
 
439 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  66.13 
 
 
443 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  60.14 
 
 
442 aa  520  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  59.67 
 
 
442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  59.02 
 
 
449 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  59.95 
 
 
442 aa  504  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  59.43 
 
 
452 aa  497  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  59.72 
 
 
462 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  59.72 
 
 
443 aa  488  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  59.39 
 
 
440 aa  473  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  58.25 
 
 
433 aa  471  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  57.31 
 
 
440 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  56.91 
 
 
432 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  56.84 
 
 
435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  57.81 
 
 
434 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  53.52 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  55.76 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  54.8 
 
 
446 aa  436  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  54.48 
 
 
444 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  52.11 
 
 
434 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  55.53 
 
 
442 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  55.74 
 
 
441 aa  428  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  51.89 
 
 
429 aa  425  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  53.54 
 
 
451 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  54.97 
 
 
444 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  49.41 
 
 
439 aa  410  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  52.47 
 
 
445 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  51.27 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  49.77 
 
 
428 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  47.32 
 
 
434 aa  382  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  47.64 
 
 
441 aa  377  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  45.54 
 
 
421 aa  359  5e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  45.43 
 
 
468 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  42.86 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  33.64 
 
 
434 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  31.49 
 
 
478 aa  180  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  30.73 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  29.44 
 
 
494 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  29.8 
 
 
485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  29.03 
 
 
472 aa  160  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.89 
 
 
477 aa  160  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  30.2 
 
 
473 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  33.02 
 
 
497 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  30.73 
 
 
489 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  31.39 
 
 
493 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  27.88 
 
 
468 aa  143  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.74 
 
 
487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  30.63 
 
 
493 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  30.63 
 
 
493 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  28.93 
 
 
508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  27.68 
 
 
549 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  28.69 
 
 
467 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  27.91 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  27.85 
 
 
476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.51 
 
 
491 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  28.81 
 
 
493 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  26.68 
 
 
485 aa  122  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  29.27 
 
 
507 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  29.27 
 
 
507 aa  120  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  29.11 
 
 
421 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  25.07 
 
 
477 aa  114  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000307009  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  29.17 
 
 
510 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.18 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.44 
 
 
388 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  27.42 
 
 
494 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  26.82 
 
 
374 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  27.59 
 
 
440 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  25.68 
 
 
465 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  26.89 
 
 
413 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  25.29 
 
 
490 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  28.57 
 
 
419 aa  96.7  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  25.29 
 
 
390 aa  96.3  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  26.1 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  27.96 
 
 
396 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.54 
 
 
433 aa  94.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  23.92 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  30.51 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  24.02 
 
 
483 aa  92.4  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.65 
 
 
393 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  23.31 
 
 
423 aa  92  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  27.64 
 
 
397 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  24.81 
 
 
415 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.09 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  27.39 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  32.99 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  24.07 
 
 
395 aa  88.2  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  28.1 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.57 
 
 
373 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1333  diaminopimelate aminotransferase  27.55 
 
 
407 aa  86.3  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546409  normal  0.250936 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04810  vacuolar carboxypeptidase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07040)  26.32 
 
 
581 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0953418  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.5 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.35 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>