More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3482 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  86.75 
 
 		 230 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  76.79 
 
 		 238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  76.79 
 
 		 238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  76.79 
 
 		 238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  71.73 
 
 		 236 aa  330  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  66.67 
 
 		 221 aa  274  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  59.31 
 
 		 234 aa  267  8.999999999999999e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  59.42 
 
 		 245 aa  235  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  56.9 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  55.79 
 
 		 261 aa  234  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  59.48 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  53.22 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  52.65 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  51.49 
 
 		 245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  56.5 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  54.95 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  55.14 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 230 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  56.57 
 
 		 235 aa  211  5.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  50.63 
 
 		 274 aa  208  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  48.28 
 
 		 230 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  50.43 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  49.36 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  52.97 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  47.84 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  49.11 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  53.23 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  49.14 
 
 		 235 aa  187  8e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  39.17 
 
 		 223 aa  138  8.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  38.37 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 245 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 207 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 204 aa  101  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 198 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 201 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 199 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 		 200 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 209 aa  89  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 402 aa  87.8  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 		 199 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 227 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 213 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 412 aa  78.6  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.06 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.23 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.23 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.27 
 
 		 200 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.27 
 
 		 200 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 401 aa  71.6  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.57 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.34 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.5 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.34 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 445 aa  68.6  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  39.32 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.63 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.25 
 
 		 442 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  27.84 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 201 aa  67  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  23.76 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.69 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 447 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  29.51 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  30.27 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.89 
 
 		 547 aa  65.1  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  28.34 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>