More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3324 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
269 aa  544  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.4 
 
 
259 aa  447  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0177311  normal  0.151964 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.57 
 
 
262 aa  352  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.721122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.83 
 
 
262 aa  351  7e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.83 
 
 
262 aa  351  7e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
264 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1836  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 
260 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
286 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00749167  decreased coverage  0.00042824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
260 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.756544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.95 
 
 
271 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
261 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000076045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
264 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.711928  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6118  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.59 
 
 
275 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304156  normal  0.200034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1011  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.95 
 
 
258 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.968961  hitchhiker  0.00922057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2321  dehydrogenase/reductase oxidoreductase protein  46.15 
 
 
275 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.195083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0140  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.51 
 
 
261 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
257 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000620196  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1889  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
264 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0188274  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.92 
 
 
291 aa  188  9e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.06 
 
 
264 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000179752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.19 
 
 
263 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
269 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421935 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
271 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
273 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127379  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4161  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.209625  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.41 
 
 
267 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.294207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
360 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
259 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
263 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.577459 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
256 aa  167  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.322734  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2906  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.91 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.79 
 
 
255 aa  165  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
273 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3579  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.01 
 
 
258 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.392131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.623441 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1378  hypothetical protein  36.22 
 
 
259 aa  160  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2585  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.49 
 
 
257 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
263 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19807  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
260 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.563613  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1809  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
263 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
259 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82399  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
272 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.605078  normal  0.514892 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1382  hypothetical protein  35.32 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
258 aa  155  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.859893  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11577  ketoacyl reductase  41.94 
 
 
267 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.08 
 
 
292 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2063  short-chain dehydrogenase  41.12 
 
 
261 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247773  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08440  putative short chain alcohol dehydrogenase  40.91 
 
 
266 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000229698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.63 
 
 
262 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3938  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
262 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.999856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4202  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
269 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18580  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  38.85 
 
 
258 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.489964  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
266 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
276 aa  149  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0799  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.5 
 
 
266 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.69 
 
 
266 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
263 aa  149  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.84 
 
 
266 aa  148  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.197421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5585  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.892025  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2448  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.3 
 
 
259 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3621  short-chain dehydrogenase  36.95 
 
 
258 aa  145  6e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2864  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
289 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.327148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
259 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4474  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.37 
 
 
270 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000662369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
262 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0666  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
343 aa  143  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.019294  hitchhiker  0.000464867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2195  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
250 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.92313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0124  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
269 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0423  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
259 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0350  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.67 
 
 
259 aa  142  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000771311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
264 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036497  normal  0.609933 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3244  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
262 aa  141  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3398  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.35 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0274  short chain dehydrogenase/reductase family protein  39.13 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000430049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2064  oxidoreductase ( short-chain dehydrogenase)  40 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.694867  normal  0.0846624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
298 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
270 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 
261 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.596662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
261 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4275  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  38.71 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0601  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.01 
 
 
258 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.44 
 
 
255 aa  139  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 
272 aa  138  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.240814  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 
223 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.47 
 
 
266 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2349  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 
266 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341044  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
259 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4572  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01284  dehydrogenase  35.69 
 
 
266 aa  135  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3329  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 
256 aa  135  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.227726  hitchhiker  0.00265893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>