169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3219 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 395 aa  755    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  73.42 
 
 		 416 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  73.42 
 
 		 416 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  72.6 
 
 		 401 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  51.55 
 
 		 416 aa  335  5.999999999999999e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  50.67 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  51.34 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  50.28 
 
 		 409 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  48.19 
 
 		 404 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  34.12 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  35.56 
 
 		 416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 411 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 425 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 399 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  32.44 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 387 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 426 aa  119  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  29.95 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  31.84 
 
 		 415 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30.08 
 
 		 402 aa  113  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  37.79 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  30.59 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 393 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 397 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 411 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 404 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  38.6 
 
 		 216 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  28.57 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 400 aa  86.3  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  26.65 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  28.06 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  28.08 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 386 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  27.37 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  24.1 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.05 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5086  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.90358  hitchhiker  0.0097128 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  24.12 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000377663  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  23.82 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1663  major facilitator superfamily transporter  24.86 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.145421  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1346  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.217122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  23.31 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  26.32 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>