91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3218 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3218  secreted protein  100 
 
 
441 aa  865    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4494  FAD dependent oxidoreductase  59.82 
 
 
497 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.306452  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  52.13 
 
 
759 aa  401  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0225  FAD dependent oxidoreductase  54.67 
 
 
453 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3656  FAD dependent oxidoreductase  52.82 
 
 
468 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8611  peptidase M28  53.11 
 
 
764 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0628073  normal  0.216372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2664  FAD dependent oxidoreductase  52 
 
 
469 aa  389  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.312794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0491  putative secreted protein  50.23 
 
 
442 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.557895  hitchhiker  0.0044003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3968  putative secreted protein  54.34 
 
 
471 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0385  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 
468 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4433  putative secreted protein  50.81 
 
 
456 aa  379  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0215  FAD dependent oxidoreductase  51.82 
 
 
461 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31150  predicted flavoprotein involved in K+ transport  50 
 
 
446 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2824  putative secreted protein  48.3 
 
 
434 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000320081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4964  hypothetical protein  49.45 
 
 
453 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0874599  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5388  hypothetical protein  51.82 
 
 
497 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.836925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2281  FAD dependent oxidoreductase  49.23 
 
 
494 aa  364  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.901195  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0633  FAD dependent oxidoreductase  52.2 
 
 
424 aa  363  3e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4717  FAD dependent oxidoreductase  53.21 
 
 
476 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.950663  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20640  predicted flavoprotein involved in K+ transport  50.23 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5580  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  51.16 
 
 
454 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14630  predicted flavoprotein involved in K+ transport  48.76 
 
 
461 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1915  putative secreted protein  50.69 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0518  putative secreted protein  49.31 
 
 
445 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.312569  hitchhiker  0.00121431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0074  FAD dependent oxidoreductase  50.49 
 
 
405 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5381  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.08 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3424  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.61 
 
 
362 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319709  normal  0.250706 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1217  hypothetical protein  25.89 
 
 
327 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000500941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1417  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.37 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1550  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.6 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000311717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00734465  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1983  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.36 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.635094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3795  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.78 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000252573  hitchhiker  0.00000000266911 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1589  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.48 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75583e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1656  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.7 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000378104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1377  thioredoxin reductase  24.48 
 
 
326 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1376  thioredoxin reductase  24.48 
 
 
326 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0895595  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2792  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  21.91 
 
 
322 aa  63.9  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1405  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.18 
 
 
326 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0297448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1280  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.1 
 
 
330 aa  62.4  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1515  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  24.18 
 
 
326 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898092  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1566  putative oxidoreductase  27.2 
 
 
363 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000646977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0413  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.14 
 
 
358 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.453898  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1925  monooxygenase, putative  28.16 
 
 
360 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000362928 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2147  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.49 
 
 
331 aa  57  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00308891  normal  0.0129855 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5666  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.81 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0188847  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4060  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26 
 
 
334 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0593579  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4968  putative flavoprotein  30.4 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2494  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.15 
 
 
335 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2135  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.87 
 
 
360 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000125506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2381  oxidoreductase  27.25 
 
 
374 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0222759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3387  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.11 
 
 
348 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557083  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2127  monooxygenase FAD-binding protein  27.51 
 
 
524 aa  50.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00953551  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.48 
 
 
390 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  28.44 
 
 
552 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.45 
 
 
348 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2384  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.39 
 
 
378 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0867216 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0446  HI0933 family protein  22.56 
 
 
330 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1512  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.55 
 
 
356 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2182  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.8 
 
 
326 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4106  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.8 
 
 
536 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15738  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1138  monooxygenase flavin-binding family protein  27.35 
 
 
497 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139531  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1026  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.97 
 
 
352 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4245  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.51 
 
 
393 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  27.74 
 
 
391 aa  47  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  31.94 
 
 
329 aa  46.6  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000326035  hitchhiker  0.0000549651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0078  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.83 
 
 
330 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1908  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.57 
 
 
357 aa  46.6  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.59 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4167  flavin-containing monooxygenase  30.63 
 
 
480 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0862  hypothetical protein  23.58 
 
 
446 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2686  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.82 
 
 
330 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.493272  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2331  HI0933-like protein protein  26.2 
 
 
338 aa  45.8  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3895  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.75 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0541  hypothetical protein  21.43 
 
 
558 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.9586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3364  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.17 
 
 
363 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2142  flavin-containing monooxygenase  23.86 
 
 
442 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23479  normal  0.438077 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3388  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  22.22 
 
 
352 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0893  hypothetical protein  23.17 
 
 
446 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
382 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.831286  normal  0.472558 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3453  alkyl hydroperoxide reductase, F subunit  32.56 
 
 
522 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.455545  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1887  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.72 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  22.9 
 
 
316 aa  44.3  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3741  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.15 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3024  thioredoxin reductase  38.46 
 
 
325 aa  43.9  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.352085 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.49 
 
 
390 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4506  cyclohexanone monooxygenase  30.21 
 
 
661 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.569378  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2978  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
382 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2934  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
382 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.217233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>