More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3217 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
95 aa  190  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  68.67 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  71.43 
 
 
120 aa  120  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  65.85 
 
 
125 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  65.85 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  61.11 
 
 
127 aa  118  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  64.63 
 
 
125 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  67.95 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  64.56 
 
 
127 aa  114  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  57.83 
 
 
124 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  61.45 
 
 
137 aa  111  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  57.78 
 
 
131 aa  110  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  59.77 
 
 
129 aa  110  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  56.82 
 
 
125 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  62.2 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  54.12 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  59.76 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  65.75 
 
 
120 aa  106  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  58.02 
 
 
121 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  63.51 
 
 
124 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  56.79 
 
 
125 aa  103  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  57.69 
 
 
121 aa  100  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  56.1 
 
 
119 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  52.87 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  54.43 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  49.43 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  54.65 
 
 
183 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  55.17 
 
 
108 aa  97.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  53.33 
 
 
120 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  51.9 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  55.7 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  51.81 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  53.33 
 
 
120 aa  95.9  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  55.84 
 
 
109 aa  95.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  48.78 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
105 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  52.56 
 
 
126 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 
123 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.19 
 
 
115 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  48.78 
 
 
123 aa  91.3  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  48.86 
 
 
124 aa  90.5  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  48.78 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  69.09 
 
 
68 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
119 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
120 aa  88.6  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
126 aa  87.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 
113 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  52.17 
 
 
349 aa  87  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  47.14 
 
 
336 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  55.22 
 
 
337 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  49.28 
 
 
347 aa  84.3  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  51.9 
 
 
116 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 
337 aa  80.1  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  41.05 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  44.87 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2050  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 
107 aa  75.5  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  48.61 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0726  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
90 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.676551  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  46.58 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  44.87 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  45.33 
 
 
117 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  49.3 
 
 
120 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  41.3 
 
 
354 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12351  ArsR family regulatory protein  35 
 
 
90 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1200  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  41.11 
 
 
349 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0018  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
342 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  44.16 
 
 
341 aa  72  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  43.59 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4284  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  50 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  45.68 
 
 
317 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  35.96 
 
 
105 aa  71.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
109 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0534  transcriptional regulator, ArsR family  40.78 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  54 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
120 aa  71.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25920  regulatory protein, ArsR family  42.17 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0211  arsenical resistance operon repressor  37.5 
 
 
105 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3114  transcriptional regulator, ArsR family  36.47 
 
 
110 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.114989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5377  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0264  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11041  regulatory proteins, ArsR family protein  42.86 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  41.98 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 
117 aa  70.1  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
107 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  51.47 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  51.47 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>