38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3214 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 112 aa  226  6e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  63.89 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  58.88 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  57.8 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.63 
 
 		 112 aa  124  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.13 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  56.76 
 
 		 111 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  55.96 
 
 		 110 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  55.05 
 
 		 277 aa  114  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  57.41 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  55.05 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.89 
 
 		 114 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  50.47 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  50.47 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  50.47 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  46.79 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.54 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  49.53 
 
 		 110 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  49.54 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  44.86 
 
 		 110 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  47.66 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  39.09 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  47.25 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  39.78 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  45.05 
 
 		 110 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  41.76 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  40 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  39.13 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.54 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  38.57 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1304  cupin 2 domain-containing protein  43.08 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  37.14 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0944  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5777  hypothetical protein  37.88 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2777  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0722963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2471  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.14 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.285762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>