48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3081 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3081  urease accessory protein UreF  100 
 
 
214 aa  408  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0460127  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3351  urease accessory protein UreF  84.11 
 
 
214 aa  347  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.742339  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11879  urease accessory protein ureF  68.69 
 
 
211 aa  281  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2831  urease accessory protein UreF  75.86 
 
 
211 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2804  urease accessory protein UreF  75.37 
 
 
211 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2848  urease accessory protein UreF  75.37 
 
 
211 aa  262  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2754  hypothetical protein  59.24 
 
 
216 aa  192  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00731615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0192  urease accessory protein UreF  45.49 
 
 
257 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0831  putative urease accessory protein  41.74 
 
 
265 aa  123  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5698  urease accessory protein UreF  44.29 
 
 
244 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244075  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6442  putative urease accessory protein  42.04 
 
 
226 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0548041  normal  0.22219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3205  hypothetical protein  41.63 
 
 
221 aa  102  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0166827  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03290  urease accessory protein UreF  37.12 
 
 
243 aa  99  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0505  hypothetical protein  50.88 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3408  putative urease accessory protein  39.06 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3505  Urease accessory protein UreF  36.27 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0273  Urease accessory protein UreF-like protein  33.49 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4416  Urease accessory protein UreF  27.11 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0974  hypothetical protein  37.97 
 
 
218 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4050  hypothetical protein  40.65 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7006  urease accessory protein UreF  29.63 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.891807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0696  Urease accessory protein UreF-like protein  36.62 
 
 
302 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0364387  unclonable  0.00000000313783 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1476  Urease accessory protein UreF  28.49 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0566307  normal  0.716543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1135  urease accessory protein UreF  24.03 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3558  urease accessory protein  24.46 
 
 
228 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45506  normal  0.0231315 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1081  urease accessory protein UreF  24.03 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3660  urease accessory protein UreF  23.9 
 
 
232 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.098957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3690  urease accessory protein UreF  29.57 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0722  Urease accessory protein UreF  25 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0272  urease accessory protein UreF, putative  27.65 
 
 
228 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1553  Urease accessory protein UreF  28.28 
 
 
266 aa  45.1  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0286  putative urease accessory protein UreF  28.43 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1360  urease accessory protein UreF, putative  27.39 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4214  urease accessory protein UreF  40.28 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1960  putative urease accessory protein UreF  30.14 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1702  Urease accessory protein UreF  30.23 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0751  urease accessory protein UreF  24.77 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2769  Urease accessory protein UreF  23.46 
 
 
225 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1814  urease accessory protein UreF  28.07 
 
 
240 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4833  urease accessory protein UreF  22.71 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0337  urease accessory protein UreF, putative  28.5 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1303  urease accessory protein UreF  27.39 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1465  Urease accessory protein UreF  27.39 
 
 
240 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0562  urease accessory protein UreF  27.87 
 
 
224 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1262  urease accessory protein  22.02 
 
 
233 aa  42.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1029  urease accessory protein UreF  28.98 
 
 
231 aa  42  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.185094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4452  urease accessory protein UreF  25.25 
 
 
224 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2878  urease accessory protein UreF  30.51 
 
 
224 aa  41.6  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>