30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2947 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2947  putative integral membrane protein  100 
 
 
262 aa  519  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.704391  normal  0.150351 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13267  integral membrane protein  68.46 
 
 
244 aa  310  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.849706  normal  0.37238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3499  putative integral membrane protein  66.39 
 
 
257 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.23601  normal  0.728118 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3486  putative integral membrane protein  66.39 
 
 
257 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379383  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3549  putative integral membrane protein  66.39 
 
 
257 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.393882  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0003  hypothetical protein  52.07 
 
 
257 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0005  putative integral membrane protein  52.07 
 
 
257 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2587  putative integral membrane protein  52.21 
 
 
252 aa  264  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3176  hypothetical protein  52.67 
 
 
266 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4814  putative integral membrane protein  49.38 
 
 
248 aa  248  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6423  hypothetical protein  54.51 
 
 
244 aa  248  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7385  hypothetical protein  54 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2945  putative integral membrane protein  55.46 
 
 
245 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4173  putative integral membrane protein  54.98 
 
 
279 aa  241  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5015  hypothetical protein  50.84 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3401  hypothetical protein  29.25 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0910  hypothetical protein  27.5 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1791  Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase  30.98 
 
 
191 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.823427 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3239  hypothetical protein  28.64 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.303297  normal  0.187673 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0660  hypothetical protein  30.93 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2171  hypothetical protein  29.41 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0717446  normal  0.0305929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3040  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  32.61 
 
 
197 aa  59.3  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1980  hypothetical protein  29.32 
 
 
193 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0006793  normal  0.0779931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1926  hypothetical protein  29.26 
 
 
197 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3566  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  36.89 
 
 
196 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.273519  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0359  putative integral membrane protein  29.9 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1324  hypothetical protein  29.02 
 
 
196 aa  48.9  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3864  hypothetical protein  37.78 
 
 
174 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0074  hypothetical protein  32.2 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.535249 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2950  S-isoprenylcysteine methyltransferase-like protein  33.33 
 
 
205 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>