26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2946 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2946  cation efflux protein  100 
 
 		 327 aa  645    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  25.82 
 
 		 302 aa  86.7  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  25.93 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  28.98 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  24.69 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1884  Co/Zn/Cd cation transporter  22.4 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0281  cation diffusion facilitator family transporter  25.54 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0952355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  21.79 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1874  cation efflux family protein  21.13 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135582  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1502  cation diffusion facilitator family transporter  25.71 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000419943  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2718  cation efflux protein  25.47 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1766  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000394316  hitchhiker  0.00956613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1607  cation diffusion facilitator family transporter  25.24 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0711616  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  23.79 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2127  cation diffusion facilitator family transporter  23.79 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  24.1 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  27.34 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  26.32 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  32.94 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0401  hypothetical protein  21.95 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.414063  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  23.15 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1684  CDF family cation efflux system protein  38.89 
 
 		 74 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.990903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  22.33 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  30.34 
 
 		 323 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1685  CDF family cation efflux system protein  38.36 
 
 		 83 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.890428  normal  0.971407 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  27.32 
 
 		 483 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>