More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2942 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2942  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 240 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0684718  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2727  GntR family transcriptional regulator  81.86 
 
 		 239 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.45563  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2771  GntR family transcriptional regulator  81.86 
 
 		 239 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2757  GntR family transcriptional regulator  81.01 
 
 		 239 aa  350  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.578268  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10597  GntR family transcriptional regulator  66.09 
 
 		 240 aa  291  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0011  GntR family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 249 aa  262  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4488  regulatory protein GntR HTH  55.08 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7456  regulatory protein GntR HTH  43.86 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0768739  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1196  regulatory protein GntR HTH  36.05 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185208  hitchhiker  0.000709934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  38.26 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  37.58 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  36.32 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0114  regulatory protein GntR HTH  27.75 
 
 		 260 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 241 aa  85.1  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  37.8 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.42 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10503  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000487705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0277  regulatory protein GntR HTH  38.59 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  36.11 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.82 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.18 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0357  regulatory protein GntR HTH  31.9 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000241267  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  34.66 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  36.92 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  30.63 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  30.71 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  27.16 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  33.78 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  34.91 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.58 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1490  fatty acid metabolism regulator  36.84 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  31.1 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  39.1 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01148  fatty acid metabolism regulator  30.25 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0433911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3488  fatty acid metabolism regulator  31.25 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00186982  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02929  fatty acid metabolism regulator  37.89 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002979  transcriptional regulator for fatty acid degradation FadR GntR family  37.89 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  45.21 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.73 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  44.14 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  33.73 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  45.45 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 		 244 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 251 aa  72  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01162  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000799515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2461  fatty acid metabolism transcriptional regulator FadR  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000004944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2109  fatty acid metabolism regulator  28.4 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109018  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1947  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0438592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1328  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1962  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000133841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  37.24 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1345  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00238872  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  29.8 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1943  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0247778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  29.8 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2130  regulatory protein GntR HTH  28.29 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0857174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2363  fatty acid metabolism regulator  28.4 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000339682  normal  0.326287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2003  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  29.8 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  29.8 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01172  hypothetical protein  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000480756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1999  fatty acid metabolism regulator  28.4 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00814717  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  29.8 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1290  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000557847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2438  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000216625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1513  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.127061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1332  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000305633  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1674  fatty acid metabolism regulator  32.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000616517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2748  fatty acid metabolism regulator  30.12 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000401699  decreased coverage  0.0000363622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  29.88 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  29.88 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  28.86 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  29.88 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  30.88 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2794  fatty acid metabolism regulator  29.01 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00556903  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  29.88 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  29.88 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  29.88 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  35.57 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2365  fatty acid metabolism regulator  32.06 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000203201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2087  fatty acid responsive transcription factor FadR domain protein  28.29 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30946e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  29.88 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>