More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2899 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  83.68 
 
 		 457 aa  699    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  83.68 
 
 		 457 aa  699    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  79.16 
 
 		 439 aa  684    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  83.68 
 
 		 457 aa  699    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 430 aa  843    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  49.88 
 
 		 482 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  49.4 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.2 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  44.14 
 
 		 472 aa  346  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 450 aa  338  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  43.91 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  43.76 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 433 aa  333  5e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 461 aa  332  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  43.87 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  41.28 
 
 		 443 aa  324  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  42.62 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  42.62 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  42.62 
 
 		 461 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  45.41 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  42.53 
 
 		 460 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 439 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  42.37 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  42.72 
 
 		 439 aa  316  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  40.92 
 
 		 484 aa  315  9e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  44.68 
 
 		 438 aa  313  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  42.72 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  44.17 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  43.11 
 
 		 441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  40.28 
 
 		 456 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  45.52 
 
 		 439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2269  shikimate transporter  41.49 
 
 		 439 aa  308  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2900  major facilitator transporter  40.09 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  39.68 
 
 		 447 aa  306  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 		 446 aa  305  8.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  43.19 
 
 		 435 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  40.32 
 
 		 447 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  39.44 
 
 		 438 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  40.53 
 
 		 436 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  41.44 
 
 		 438 aa  303  6.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  41.44 
 
 		 438 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  41.93 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.168346 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  41.44 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  41.44 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 452 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  41.44 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  41.19 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.19 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.12 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  41.19 
 
 		 438 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6035  shikimate transporter  40.23 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.22 
 
 		 437 aa  299  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  40.29 
 
 		 465 aa  299  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 439 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  41.64 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  37.59 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  44.82 
 
 		 439 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 432 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  41.11 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  40.24 
 
 		 456 aa  296  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.81 
 
 		 438 aa  295  9e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  39.39 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  39.85 
 
 		 435 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 439 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1221  shikimate transporter  39.61 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  39.76 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  41.95 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  39.76 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  40.85 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1566  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0376  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538502  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1226  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278518  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1753  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0419  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2868  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.590203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2985  major facilitator family transporter  44.36 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.464085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  39.48 
 
 		 465 aa  293  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  38.93 
 
 		 459 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  39.95 
 
 		 450 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 448 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  41.14 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 450 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  38.85 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  42.41 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>