More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2776 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  59.73 
 
 		 228 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 280 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0103  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245867 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  35 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  42.62 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 273 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 228 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 273 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5451  transcriptional regulator TetR family  23.61 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 248 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4891  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 261 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164408  normal  0.287477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 275 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 221 aa  52  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 248 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1665  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.271808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1778  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677686  unclonable  0.000000000627047 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  43.64 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>