52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2717 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  100 
 
 
303 aa  594  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  84.49 
 
 
302 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  72.52 
 
 
303 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  72.52 
 
 
303 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  72.52 
 
 
303 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  69.64 
 
 
303 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  57.67 
 
 
305 aa  328  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  56 
 
 
304 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  54.43 
 
 
379 aa  305  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  52.29 
 
 
338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  52.32 
 
 
430 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  46.58 
 
 
306 aa  271  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  49.5 
 
 
313 aa  271  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  49.84 
 
 
406 aa  262  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  48.67 
 
 
305 aa  257  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  43.33 
 
 
310 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  43.48 
 
 
311 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  49.18 
 
 
302 aa  235  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  47.81 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  45.95 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  48.98 
 
 
308 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  44.04 
 
 
313 aa  228  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  47.14 
 
 
319 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  46.64 
 
 
314 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  46.6 
 
 
313 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  41.31 
 
 
338 aa  219  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  45.97 
 
 
376 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  42.48 
 
 
571 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  46.78 
 
 
303 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  37.91 
 
 
341 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  43.65 
 
 
337 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  45.15 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  43.87 
 
 
370 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  41.56 
 
 
337 aa  199  5e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  44.44 
 
 
303 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  40.72 
 
 
318 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  42.76 
 
 
340 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  39.18 
 
 
373 aa  175  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.07 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  32.72 
 
 
378 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  26.51 
 
 
370 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  32.52 
 
 
429 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  28.57 
 
 
377 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.1 
 
 
428 aa  48.5  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1499  OpcA protein  25.77 
 
 
456 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.51933e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  24.31 
 
 
456 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  24.7 
 
 
435 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0685  OpcA protein  23.53 
 
 
440 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0954388 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  23.4 
 
 
435 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.1 
 
 
435 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2333  opcA protein  27.62 
 
 
445 aa  42.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3859  OpcA protein  22.22 
 
 
456 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>