More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2693 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  87.68 
 
 
203 aa  349  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  80.3 
 
 
203 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  80.3 
 
 
203 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  79.8 
 
 
203 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  74.87 
 
 
201 aa  294  6e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  71.36 
 
 
207 aa  276  2e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  70.05 
 
 
215 aa  268  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  71.79 
 
 
220 aa  256  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  68.69 
 
 
209 aa  251  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  68.21 
 
 
202 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  70.73 
 
 
212 aa  244  8e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  66.5 
 
 
221 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  64 
 
 
204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  67 
 
 
199 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 
205 aa  238  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  63.82 
 
 
202 aa  237  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  64.65 
 
 
223 aa  236  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  64.68 
 
 
210 aa  235  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  62.07 
 
 
217 aa  225  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  61.14 
 
 
208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  63.13 
 
 
204 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  60.68 
 
 
208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  62.12 
 
 
200 aa  213  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  56.35 
 
 
193 aa  211  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  53.88 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  51.91 
 
 
238 aa  193  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  51.2 
 
 
226 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  53.23 
 
 
215 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  48.48 
 
 
207 aa  184  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  52 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  48.02 
 
 
215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  52.43 
 
 
227 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  53.62 
 
 
233 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  54.64 
 
 
196 aa  180  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  50.49 
 
 
221 aa  179  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 
218 aa  177  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.9 
 
 
214 aa  177  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.26 
 
 
214 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 
222 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  53.89 
 
 
204 aa  176  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  48.29 
 
 
219 aa  175  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  52.5 
 
 
214 aa  175  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  52.31 
 
 
221 aa  174  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.72 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  46.86 
 
 
221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  49.76 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  51.27 
 
 
201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 
226 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  49.49 
 
 
199 aa  170  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  50.26 
 
 
220 aa  170  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  51.52 
 
 
219 aa  170  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  46.46 
 
 
217 aa  169  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  48.06 
 
 
218 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  47 
 
 
217 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  49.22 
 
 
218 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  50.52 
 
 
223 aa  169  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 
219 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  49.22 
 
 
218 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  47.57 
 
 
218 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 
219 aa  168  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  48.06 
 
 
218 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  48.06 
 
 
218 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 
218 aa  168  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 
218 aa  168  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 
217 aa  168  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  46.6 
 
 
220 aa  167  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  47.94 
 
 
224 aa  167  9e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  51.02 
 
 
215 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 
214 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 
218 aa  167  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 
220 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 
220 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 
218 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 
217 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 
217 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  47.6 
 
 
217 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 
217 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  45.63 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  47.57 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 
217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  47.69 
 
 
208 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  47.15 
 
 
204 aa  165  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  48.77 
 
 
208 aa  165  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  43.4 
 
 
232 aa  165  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  46.48 
 
 
239 aa  165  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 
220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  44.85 
 
 
216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  44.88 
 
 
220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  47.2 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 
221 aa  162  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  49.28 
 
 
251 aa  161  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>