More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2635 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  81.97 
 
 		 452 aa  655    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  91.2 
 
 		 446 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  84.25 
 
 		 445 aa  714    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  84.47 
 
 		 445 aa  716    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  84.47 
 
 		 445 aa  716    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 429 aa  850    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  73.13 
 
 		 456 aa  625  1e-178  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  71.93 
 
 		 460 aa  580  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  69.56 
 
 		 448 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  70.69 
 
 		 457 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  64.07 
 
 		 494 aa  521  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  65.81 
 
 		 456 aa  522  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  65.65 
 
 		 445 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  62.76 
 
 		 502 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  62.62 
 
 		 477 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  59.21 
 
 		 519 aa  511  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  63.68 
 
 		 448 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  60.42 
 
 		 461 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  61.74 
 
 		 463 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  61.94 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  63.07 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  61.36 
 
 		 484 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  63.06 
 
 		 456 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  62.3 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  63.74 
 
 		 474 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  61.4 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  61.01 
 
 		 464 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  61.24 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  61.37 
 
 		 441 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  60.18 
 
 		 478 aa  478  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  59.19 
 
 		 490 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  61.89 
 
 		 456 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  60.62 
 
 		 473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  60.4 
 
 		 465 aa  467  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  63.28 
 
 		 466 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  54.75 
 
 		 459 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  53.62 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  52.77 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 		 450 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 438 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  61.33 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  48.22 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  48.83 
 
 		 440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  48.19 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  50.6 
 
 		 441 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  51.46 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  48.8 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  50.35 
 
 		 458 aa  395  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  46.95 
 
 		 448 aa  392  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  47.03 
 
 		 432 aa  388  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  45.77 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  47.82 
 
 		 437 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  53.3 
 
 		 429 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  47.61 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.1 
 
 		 731 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  48.1 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  47.37 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  47.45 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.34 
 
 		 739 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  47.12 
 
 		 453 aa  377  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  46.78 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  46.56 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  47.8 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.66 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  47.54 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  45.29 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  48.28 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  47.73 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  44.87 
 
 		 439 aa  372  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  47.96 
 
 		 446 aa  368  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  44.68 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  47.8 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  49.51 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  47.47 
 
 		 459 aa  365  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1401  recombination factor protein RarA  48.3 
 
 		 451 aa  364  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  47.54 
 
 		 447 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  45.81 
 
 		 726 aa  363  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5868  AAA ATPase central domain protein  51.2 
 
 		 427 aa  363  4e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  44.66 
 
 		 428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1704  ATPase central domain-containing protein  47.75 
 
 		 448 aa  362  6e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3254  recombination factor protein RarA  44.96 
 
 		 455 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0183203  hitchhiker  0.0000000120861 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1498  AAA ATPase central domain protein  43.44 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  48.88 
 
 		 423 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  47.41 
 
 		 449 aa  360  4e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  42.21 
 
 		 445 aa  359  5e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  44.42 
 
 		 428 aa  358  7e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  46.52 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  43.03 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0094  recombination factor protein RarA  47.51 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  46.32 
 
 		 447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0103  recombination factor protein RarA  47.86 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  44.94 
 
 		 447 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  45.15 
 
 		 447 aa  356  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  44.31 
 
 		 428 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  44.08 
 
 		 428 aa  356  5e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  44.31 
 
 		 428 aa  356  5e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  43.84 
 
 		 428 aa  356  5e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  44.08 
 
 		 428 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>