More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2623 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
287 aa  566  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  90.07 
 
 
286 aa  510  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.44 
 
 
286 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.44 
 
 
286 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.44 
 
 
286 aa  401  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.81 
 
 
283 aa  325  7e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
313 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
308 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  37.64 
 
 
280 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
286 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  37.64 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
309 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
294 aa  180  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
300 aa  179  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
294 aa  175  7e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
312 aa  175  7e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  33.67 
 
 
318 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
312 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
313 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.43 
 
 
298 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  33.46 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
307 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
316 aa  161  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
309 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
299 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270687  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.41 
 
 
310 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
295 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
310 aa  159  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7824  putative ABC transporter permease protein  34.15 
 
 
295 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
296 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
330 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0817185  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
330 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
289 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
289 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
289 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
289 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
435 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0548  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  39.83 
 
 
288 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
298 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0164712  normal  0.951999 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.82 
 
 
289 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
311 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.704951 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0940  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.06 
 
 
289 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1742  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
292 aa  152  7e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
318 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4988  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
301 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
301 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
280 aa  149  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.86 
 
 
304 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.72 
 
 
314 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
309 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
286 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
317 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.140823  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
304 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
306 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
427 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3143  sugar ABC transporter  34.69 
 
 
290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382012  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.35 
 
 
318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177004  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3226  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
318 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.24 
 
 
332 aa  146  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
314 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.22308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115668  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
320 aa  145  9e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  35.29 
 
 
292 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
296 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
306 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
312 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 
325 aa  142  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7366  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.08 
 
 
278 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
293 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
293 aa  142  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 
325 aa  142  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
290 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
310 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.57 
 
 
318 aa  140  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
315 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0566553  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
322 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4978  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
298 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  0.0538219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>