More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2569 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2569  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1733  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 213 aa  174  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0446931  hitchhiker  0.00691691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 		 220 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  38.34 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  38.97 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2249  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.111246  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28140  transcriptional regulator  38.51 
 
 		 216 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0472  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.957077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0483  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0459  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 193 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 202 aa  95.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 185 aa  94  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 208 aa  94  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1366  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0482522  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  31.07 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2830  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.082996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  46.81 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1851  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2967  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 332 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10262  hypothetical protein  29.69 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.277133  normal  0.125869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  56.82 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3055  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2226  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.407434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 258 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 189 aa  51.2  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  39.58 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  39.58 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2550  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.714249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2589  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0467088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2595  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 232 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  39.58 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  39.58 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  39.58 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  39.58 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 258 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  39.58 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3014  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00422654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3188  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 125 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 291 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2889  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00514184  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>