More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2548 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 216 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  91.94 
 
 		 216 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  90.65 
 
 		 220 aa  380  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  90.65 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  90.65 
 
 		 215 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  86.11 
 
 		 217 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  87.74 
 
 		 212 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  86.54 
 
 		 228 aa  343  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  86.54 
 
 		 228 aa  343  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  86.54 
 
 		 228 aa  343  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.12 
 
 		 219 aa  304  6e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  64.95 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  68.54 
 
 		 218 aa  285  5e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  61.81 
 
 		 213 aa  263  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.4 
 
 		 222 aa  257  9e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  60.3 
 
 		 214 aa  254  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  61.24 
 
 		 219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  59.22 
 
 		 221 aa  252  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.41 
 
 		 226 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.35 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.28 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  59.71 
 
 		 231 aa  241  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  60.37 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  58.74 
 
 		 231 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  61.32 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 212 aa  234  8e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.45 
 
 		 216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  55.56 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  57.77 
 
 		 216 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  59.9 
 
 		 223 aa  231  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.19 
 
 		 233 aa  227  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  55.66 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  57 
 
 		 254 aa  224  9e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 211 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  53.88 
 
 		 218 aa  223  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.71 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.61 
 
 		 209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 216 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 244 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.07 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 218 aa  208  6e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.4 
 
 		 226 aa  207  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1659  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.319135  normal  0.0403017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2290  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.77 
 
 		 208 aa  168  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00802134  hitchhiker  0.000628596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  41.15 
 
 		 242 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11330  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.06 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0103975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1992  response regulator receiver protein  60.98 
 
 		 137 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108622  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0516  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.16 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0765  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 222 aa  148  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0214  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.27 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  38.94 
 
 		 234 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  38.28 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1936  regulatory protein LuxR  39.9 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.548655  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.49 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  37.98 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.07 
 
 		 213 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 215 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  36.76 
 
 		 210 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  39.3 
 
 		 207 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  36.76 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  36.1 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  36.76 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  36.76 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  36.76 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  36.76 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  37.8 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  36.76 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>