242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2508 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2508  phage integrase family protein  100 
 
 		 385 aa  781    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2218  phage integrase family protein  69.09 
 
 		 388 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3899  phage integrase family protein  65.63 
 
 		 379 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12675  phiRv2 prophage integrase  56.35 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000114455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3499  integrase family protein  55.14 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000340769  hitchhiker  0.00860577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4364  phage integrase family protein  42.29 
 
 		 373 aa  275  7e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  0.417396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3913  phage integrase family protein  38.32 
 
 		 387 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0039  integrase family protein  35.03 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0058  phage integrase family protein  34.67 
 
 		 395 aa  202  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1203  phage integrase  34.23 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00426039  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2351  integrase family protein  31.38 
 
 		 427 aa  160  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226368  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  30.84 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.84 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.83 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  28.96 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  29.39 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 368 aa  96.7  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  25.64 
 
 		 357 aa  92  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.26 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0924  integrase family protein  25.83 
 
 		 399 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  24.47 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  24.21 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.32 
 
 		 477 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  24.04 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0604  integrase family protein  28.09 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  23.63 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 368 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0424  phage integrase  22.15 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.743387  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2073  integrase family protein  27.4 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.087873  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  23.47 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  27.66 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19160  site-specific recombinase XerD  23.55 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.768051  normal  0.148917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  24.56 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.83 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.77 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  23.28 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0014  integrase family protein  29.1 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  27.92 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  25.34 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  27.52 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  24.12 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.82 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  23.51 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  24.47 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.14 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1419  integrase family protein  28.05 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.447287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1527  integrase family protein  23.91 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.115316 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.17 
 
 		 325 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1100  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  22.73 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  23.89 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.64 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  23.48 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25.08 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2293  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  22.25 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.25 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  24.86 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0074  hypothetical protein  42.7 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.532123  normal  0.327685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  24.91 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  29.34 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  24.25 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.24 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  26.79 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  25.21 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  25.16 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3648  phage integrase family protein  28.24 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215294  normal  0.165741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4448  phage integrase family protein  24.38 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.322677  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.13 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.13 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  30.68 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3323  integrase family protein  28.89 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  22.8 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  23.77 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5370  integrase family protein  26.43 
 
 		 498 aa  63.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.987782 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  23.91 
 
 		 451 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  22.4 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  23.91 
 
 		 451 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  22.61 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.33 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  22.85 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.33 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  25.63 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  24.37 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  22.44 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  26.38 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.82 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  22.79 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  26.37 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  23.88 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  23.97 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  23.97 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  22.29 
 
 		 363 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  23.51 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  28.19 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>