More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2396 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  309  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  79.01 
 
 		 162 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  79.01 
 
 		 162 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  79.01 
 
 		 162 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  54.78 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  56.52 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  54.36 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  53.64 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  54.41 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  52.63 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  45.45 
 
 		 433 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.03 
 
 		 432 aa  107  7.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  50 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0076  competence damage-inducible protein A  41.18 
 
 		 423 aa  105  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0110549  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  45.75 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  48.23 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  49.63 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.64 
 
 		 424 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  62.28 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  59.17 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3280  competence damage-inducible protein A  45.28 
 
 		 422 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  43.75 
 
 		 414 aa  98.2  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  48.84 
 
 		 427 aa  97.8  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  40.85 
 
 		 416 aa  97.4  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  47.33 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  43.97 
 
 		 168 aa  97.1  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  46 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  43.05 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0933  competence/damage-inducible protein cinA  32.67 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.329163  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  48.28 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  47.14 
 
 		 408 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  47.14 
 
 		 408 aa  94.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  38.18 
 
 		 415 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3710  CinA-like  42.66 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.909582  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.49 
 
 		 433 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  50 
 
 		 432 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2757  CinA domain-containing protein  42.66 
 
 		 166 aa  93.6  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.439876  normal  0.642955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  48.55 
 
 		 438 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  45.32 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  45.04 
 
 		 183 aa  92  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0529  CinA domain-containing protein  41.67 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  52.31 
 
 		 157 aa  91.7  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  41.3 
 
 		 413 aa  91.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  39.22 
 
 		 413 aa  91.3  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  48.55 
 
 		 410 aa  90.9  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  47.01 
 
 		 408 aa  90.5  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  41.21 
 
 		 172 aa  90.5  9e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  38.41 
 
 		 411 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  45.71 
 
 		 408 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0005  competence/damage inducible protein CinA  28.95 
 
 		 161 aa  89.7  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0553  CinA domain-containing protein  40.97 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11930  competence damage-inducible protein A  45.27 
 
 		 430 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.502036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  33.57 
 
 		 415 aa  90.1  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  35.4 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2467  CinA domain protein  40.14 
 
 		 172 aa  88.6  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  46.15 
 
 		 447 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  43.67 
 
 		 434 aa  88.6  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  40.88 
 
 		 437 aa  88.6  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  36.36 
 
 		 411 aa  87.4  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.99 
 
 		 408 aa  87.4  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2999  competence damage-inducible protein A  42.77 
 
 		 422 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.495389  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  39.86 
 
 		 415 aa  87.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  42.25 
 
 		 218 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  41.4 
 
 		 420 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  36.42 
 
 		 415 aa  87  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  41.06 
 
 		 420 aa  86.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  43.45 
 
 		 425 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0843  competence/damage-inducible protein CinA  39.44 
 
 		 416 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  34.51 
 
 		 403 aa  86.3  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02791  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.78 
 
 		 424 aa  86.3  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  34.04 
 
 		 400 aa  85.9  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1366  CinA-like  39.58 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.649556  normal  0.75874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0596  CinA domain-containing protein  40.28 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.774081  normal  0.307484 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  33.12 
 
 		 408 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  36.73 
 
 		 415 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  39.1 
 
 		 419 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0145  CinA-like  40.28 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774466  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0628  CinA domain-containing protein  40.28 
 
 		 166 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0747  competence/damage-inducible protein CinA  46.72 
 
 		 400 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.543966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2959  CinA domain protein  38.67 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0975  competence/damage-inducible domain-containing protein  40.91 
 
 		 365 aa  84.7  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  38.51 
 
 		 421 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2770  hypothetical protein  42.11 
 
 		 166 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.335276  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  36.49 
 
 		 412 aa  84.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  37.32 
 
 		 417 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0608  competence/damage-inducible domain-containing protein  33.54 
 
 		 363 aa  84.3  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000534602  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1259  cinA family protein  39.57 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2480  competence/damage-inducible protein CinA  39.57 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0447623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3442  cinA family protein  39.57 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.983742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3477  competence/damage-inducible protein CinA  39.57 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.813884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1186  competence/damage-inducible protein CinA  39.57 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3306  cinA family protein  39.57 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3479  cinA family protein  39.57 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292867  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0399  cinA family protein  39.57 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.433149  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2078  competence damage-inducible protein A  39.84 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.297659  hitchhiker  0.000644624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  36.73 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1808  CinA domain protein  39.13 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2737  competence damage-inducible protein A  42.24 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.053629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2751  competence damage-inducible protein A  42.24 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  39.39 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>