More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2344 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 531 aa  1057    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  50.65 
 
 		 539 aa  491  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  48.25 
 
 		 550 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  47.23 
 
 		 544 aa  455  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  46.96 
 
 		 545 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  47.24 
 
 		 542 aa  408  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  41.92 
 
 		 532 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  43.54 
 
 		 546 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  41.62 
 
 		 569 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  41.23 
 
 		 564 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  42.75 
 
 		 560 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  43.87 
 
 		 527 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  42.13 
 
 		 574 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  41.93 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  41.93 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  42.52 
 
 		 534 aa  359  8e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  41.52 
 
 		 548 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  41.52 
 
 		 548 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  41.52 
 
 		 548 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  41.94 
 
 		 535 aa  349  8e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  43.38 
 
 		 550 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  42.23 
 
 		 541 aa  343  5e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  40.85 
 
 		 540 aa  339  8e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 		 539 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  39.08 
 
 		 530 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  39.42 
 
 		 541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  39.69 
 
 		 544 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  38.36 
 
 		 544 aa  323  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  37.86 
 
 		 535 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 		 562 aa  306  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 560 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 518 aa  230  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.24 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 510 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.53 
 
 		 499 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.79 
 
 		 500 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  32.92 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 492 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.39 
 
 		 524 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.65 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 511 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.02 
 
 		 506 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  32.19 
 
 		 511 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 506 aa  189  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.61 
 
 		 543 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.82 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 508 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  29.42 
 
 		 515 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  29.42 
 
 		 515 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 509 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.64 
 
 		 537 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  29.42 
 
 		 515 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 		 526 aa  187  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  35.87 
 
 		 487 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  29.88 
 
 		 517 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 519 aa  187  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 516 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.63 
 
 		 509 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 509 aa  187  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 523 aa  186  7e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.58 
 
 		 514 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.61 
 
 		 506 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.61 
 
 		 506 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 524 aa  186  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.66 
 
 		 509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  32.39 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 512 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 515 aa  183  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 522 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.47 
 
 		 525 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.17 
 
 		 516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.58 
 
 		 501 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 521 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 546 aa  181  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 511 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.26 
 
 		 525 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  32.98 
 
 		 516 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 523 aa  179  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  30.8 
 
 		 527 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 507 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.01 
 
 		 516 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 501 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.06 
 
 		 525 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 516 aa  179  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.36 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 521 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.99 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  34.77 
 
 		 510 aa  177  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.99 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 513 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  31.38 
 
 		 516 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 515 aa  176  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.31 
 
 		 529 aa  176  8e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  34.57 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.96 
 
 		 522 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2385  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.738736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  28.57 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>