More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2296 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  502  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  77.14 
 
 		 257 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  64.41 
 
 		 271 aa  305  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.08 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  61.37 
 
 		 236 aa  295  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  58.87 
 
 		 248 aa  291  7e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  65.79 
 
 		 406 aa  291  9e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  60.78 
 
 		 252 aa  290  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  63.4 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  63.09 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  63.09 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  63.09 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  63.25 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  61.11 
 
 		 286 aa  277  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.08 
 
 		 254 aa  268  5e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 246 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.47 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.01 
 
 		 252 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.15 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  63.44 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.67 
 
 		 235 aa  245  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 242 aa  242  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  55.07 
 
 		 229 aa  241  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.02 
 
 		 244 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.56 
 
 		 242 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.11 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  50.43 
 
 		 241 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  53.98 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  53.98 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  53.98 
 
 		 239 aa  236  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.5 
 
 		 240 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.68 
 
 		 237 aa  235  6e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.55 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.67 
 
 		 231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  51.77 
 
 		 247 aa  232  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 238 aa  231  7.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.97 
 
 		 239 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  52.65 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.79 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 244 aa  229  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.39 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.74 
 
 		 243 aa  228  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.06 
 
 		 236 aa  228  9e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  53.36 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.97 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.47 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  51.91 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 228 aa  222  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  47.23 
 
 		 243 aa  221  7e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 230 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 230 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 230 aa  221  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 270 aa  218  6e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  45.57 
 
 		 246 aa  218  7e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  49.11 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  49.57 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  48.23 
 
 		 231 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  48.67 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  49.78 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  50.22 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 227 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  47.28 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 225 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.08 
 
 		 236 aa  208  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 224 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  47.79 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 224 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  49.56 
 
 		 237 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.55 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  46.22 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  48.96 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 224 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  48.26 
 
 		 232 aa  198  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  44.2 
 
 		 224 aa  198  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 228 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  46.43 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  47.11 
 
 		 227 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 223 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>