More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2109 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4251  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  67.06 
 
 		 603 aa  765    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2109  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 		 599 aa  1206    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2114  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.02 
 
 		 569 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.955657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 819 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000152143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.3 
 
 		 624 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  47.5 
 
 		 542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 890 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 897 aa  171  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 1001 aa  170  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  49.03 
 
 		 321 aa  166  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1608  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.12 
 
 		 1015 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00363686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 		 837 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  46.11 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4387  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 		 946 aa  162  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  43.02 
 
 		 400 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 		 680 aa  160  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 1016 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1309 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.45 
 
 		 1550 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  35.06 
 
 		 1041 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3925  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.12 
 
 		 662 aa  156  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.150145  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04155  Putative signal protein with GAF,PAS(PAC) and GGDEF domains  32.7 
 
 		 874 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.581833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 1002 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.79 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0428  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 		 943 aa  153  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.94781  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  34.11 
 
 		 500 aa  153  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  44.88 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  45.83 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3828  putative GAF sensor protein  45.28 
 
 		 226 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.673739 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  35.51 
 
 		 238 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  42.77 
 
 		 240 aa  151  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3623  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.32 
 
 		 583 aa  150  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  42.41 
 
 		 497 aa  150  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0452  sensory box protein  29.36 
 
 		 451 aa  150  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  45.3 
 
 		 438 aa  150  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.15 
 
 		 367 aa  150  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 500 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  41.51 
 
 		 249 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  44.94 
 
 		 245 aa  148  3e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2010  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.92 
 
 		 574 aa  148  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 640 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3974  signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 635 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0272817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 		 1224 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  40.88 
 
 		 249 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  40.88 
 
 		 249 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.37 
 
 		 506 aa  147  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2107  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  24.88 
 
 		 617 aa  146  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00105125  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.97 
 
 		 319 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.11 
 
 		 653 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  40.27 
 
 		 531 aa  144  6e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  49.35 
 
 		 1191 aa  144  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.28 
 
 		 326 aa  143  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  43.59 
 
 		 253 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  43.59 
 
 		 253 aa  143  9e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  42.4 
 
 		 934 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 		 1125 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 		 1965 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2072  signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 829 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3953  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.98 
 
 		 818 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.260128  decreased coverage  0.0078854 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 390 aa  140  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  42.5 
 
 		 321 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1761  sensory box protein/GGDEF family protein  33.66 
 
 		 973 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.869454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.13 
 
 		 878 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.08 
 
 		 743 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  32.36 
 
 		 1125 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  41.29 
 
 		 797 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 		 864 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  45.95 
 
 		 321 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3413  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.13 
 
 		 342 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4177  hypothetical protein  41.61 
 
 		 344 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.878015 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  44.85 
 
 		 929 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2096  diguanylate cyclase  48.03 
 
 		 584 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0309  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.4 
 
 		 827 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0510078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  36.12 
 
 		 316 aa  137  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  41.53 
 
 		 743 aa  137  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1368  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.66 
 
 		 818 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.567434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.27 
 
 		 348 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1728  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 1120 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.27 
 
 		 348 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04157  histidine kinase-response regulator hybrid protein  42.95 
 
 		 306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.851557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4396  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  41.25 
 
 		 594 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898588 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26 
 
 		 1078 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0164  diguanylate cyclase  30.55 
 
 		 437 aa  134  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.890841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 437 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0426  putative GGDEF protein  30.45 
 
 		 413 aa  134  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.631508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1352  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.23 
 
 		 818 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 		 941 aa  133  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0505  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.93 
 
 		 952 aa  133  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0510  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  47.9 
 
 		 1121 aa  133  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.294056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2479  putative GAF sensor protein  41.14 
 
 		 363 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.301075  normal  0.376583 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  44.64 
 
 		 398 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5220  putative GAF sensor protein  44.51 
 
 		 182 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.583285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3654  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.37 
 
 		 652 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  38.95 
 
 		 780 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 681 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5539  signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 677 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.62 
 
 		 740 aa  131  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  38.51 
 
 		 732 aa  131  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  42.68 
 
 		 356 aa  131  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>