49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2108 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2108  methionine synthase, vitamin-B12 independent  100 
 
 
336 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.368656  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4252  methionine synthase, vitamin-B12 independent  82.99 
 
 
336 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1858  methionine synthase, vitamin-B12 independent  75 
 
 
336 aa  501  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1924  methionine synthase, vitamin-B12 independent  75.62 
 
 
336 aa  487  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261497  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1878  methionine synthase, vitamin-B12 independent  75.31 
 
 
339 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13030  hypothetical protein  70.33 
 
 
337 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.4281699999999995e-20  normal  0.0693618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08670  cobalamin-independent methionine synthase  47.32 
 
 
362 aa  248  1e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3253  Methionine synthase vitamin-B12 independent  45.2 
 
 
336 aa  246  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3565  Methionine synthase vitamin-B12 independent  44.41 
 
 
337 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0908729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1445  Methionine synthase vitamin-B12 independent  47.68 
 
 
362 aa  229  7e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.354895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1312  Methionine synthase vitamin-B12 independent  43.54 
 
 
335 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.558991  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0602  hypothetical protein  43.24 
 
 
342 aa  218  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.441061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6042  Methionine synthase vitamin-B12 independent  46.5 
 
 
335 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8078  hypothetical protein  41.99 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1081  methionine synthase vitamin-B12 independent  43.24 
 
 
372 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17539  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2908  Methionine synthase vitamin-B12 independent  44.55 
 
 
335 aa  206  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.977615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2840  methionine synthase vitamin-B12 independent  41.57 
 
 
335 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0159  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.18 
 
 
347 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2364  Methionine synthase vitamin-B12 independent  40.54 
 
 
370 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.974097  normal  0.700828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4087  Methionine synthase vitamin-B12 independent  42.73 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1108  methionine synthase vitamin-B12 independent  45.48 
 
 
335 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.25103  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0693  methionine synthase, vitamin-B12 independent  42.72 
 
 
344 aa  185  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1215  methionine synthase, vitamin-B12 independent  43.81 
 
 
335 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3444  methionine synthase, vitamin-B12 independent  37.76 
 
 
338 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.76983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3648  methionine synthase, vitamin-B12 independent  37.1 
 
 
376 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.744365  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2719  hypothetical protein  34.33 
 
 
341 aa  137  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1311  hypothetical protein  37.5 
 
 
341 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.940222  normal  0.271335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2450  hypothetical protein  32.54 
 
 
354 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1107  hypothetical protein  37.84 
 
 
339 aa  99.8  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387618  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2407  hypothetical protein  38.66 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.522043  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10450  hypothetical protein  37.82 
 
 
347 aa  92.8  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639023  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1364  hypothetical protein  31.53 
 
 
357 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.362207 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14780  hypothetical protein  41.24 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.564122  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2940  hypothetical protein  27.71 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0730629  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0492  hypothetical protein  21.91 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.894917  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0203  hypothetical protein  26.57 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0046  hypothetical protein  30.66 
 
 
356 aa  66.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1450  hypothetical protein  28.29 
 
 
361 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000825715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_457  hypothetical protein, methionine synthase II-like protein  23.08 
 
 
342 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0516  hypothetical protein  23.68 
 
 
342 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3079  hypothetical protein  30.83 
 
 
356 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000578583  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1720  hypothetical protein  29.38 
 
 
352 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1037  hypothetical protein  25.83 
 
 
354 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2318  hypothetical protein  24 
 
 
357 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000026475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0833  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.637029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18940  hypothetical protein  33.82 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.667707  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1192  hypothetical protein  22.86 
 
 
346 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0456752 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0807  hypothetical protein  24.03 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.182765  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3098  hypothetical protein  27.62 
 
 
358 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944991  normal  0.696919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>