More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2082 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2295  cytochrome c oxidase subunit I type  67.63 
 
 
666 aa  737    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  93.66 
 
 
576 aa  1060    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1452  cytochrome c oxidase, subunit I  70.13 
 
 
583 aa  807    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0835225  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3258  Cytochrome c oxidase subunit I type  68 
 
 
588 aa  801    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1561  cytochrome c oxidase, subunit I  67.26 
 
 
567 aa  769    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0534328  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6353  Cytochrome-c oxidase  71.05 
 
 
557 aa  791    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569681  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  91.31 
 
 
573 aa  1040    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  70.59 
 
 
568 aa  782    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  71.05 
 
 
580 aa  832    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0983  cytochrome c oxidase subunit I type  72.08 
 
 
585 aa  818    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.615245  decreased coverage  0.000770913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  93.8 
 
 
581 aa  1075    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  69.6 
 
 
560 aa  791    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1016  cytochrome-c oxidase  72.07 
 
 
563 aa  802    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1695  cytochrome-c oxidase  68.97 
 
 
570 aa  778    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.373959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1960  cytochrome c oxidase, subunit I  68.45 
 
 
561 aa  759    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00322963  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1290  cytochrome c oxidase, subunit I  65.26 
 
 
564 aa  757    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.372246  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  93.63 
 
 
581 aa  1073    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  100 
 
 
581 aa  1168    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  81.41 
 
 
593 aa  982    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  71.75 
 
 
560 aa  813    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  77.01 
 
 
582 aa  887    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1687  cytochrome c oxidase, subunit I  77.34 
 
 
590 aa  910    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.418885  normal  0.0786402 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  72.56 
 
 
558 aa  817    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  80 
 
 
594 aa  974    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2081  cytochrome c oxidase, subunit I  69.14 
 
 
607 aa  802    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3917  cytochrome c oxidase, subunit I  73.86 
 
 
586 aa  849    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  71.9 
 
 
572 aa  855    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  83.16 
 
 
581 aa  994    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15640  cytochrome c oxidase, subunit I  71.99 
 
 
595 aa  808    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315417  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2671  Cytochrome-c oxidase  74.52 
 
 
554 aa  815    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.352805  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  69.12 
 
 
571 aa  765    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  65.38 
 
 
605 aa  768    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  71.9 
 
 
560 aa  815    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  72.87 
 
 
609 aa  806    Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  75.59 
 
 
588 aa  869    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14130  cytochrome c oxidase, subunit I  66.29 
 
 
570 aa  735    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341017  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  69.51 
 
 
561 aa  797    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3077  cytochrome c oxidase, subunit I  69.54 
 
 
561 aa  760    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0219994  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1953  cytochrome c oxidase, subunit I  68.66 
 
 
575 aa  800    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000175318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3501  cytochrome-c oxidase  90.04 
 
 
582 aa  990    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553433  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  93.66 
 
 
576 aa  1060    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1349  cytochrome c oxidase, subunit I  75.22 
 
 
585 aa  863    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.183517  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  89.54 
 
 
592 aa  1051    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  93.8 
 
 
581 aa  1077    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  69.66 
 
 
582 aa  831    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1886  cytochrome c oxidase, subunit I  65.52 
 
 
594 aa  792    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16240  cytochrome c oxidase, subunit I  68.53 
 
 
603 aa  768    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0056616  normal  0.613337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  91.56 
 
 
584 aa  1047    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3449  cytochrome-c oxidase  90.04 
 
 
582 aa  991    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12210  cytochrome c oxidase, subunit I  67.74 
 
 
551 aa  773    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0161218  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  93.66 
 
 
576 aa  1060    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3438  cytochrome-c oxidase  90.04 
 
 
582 aa  990    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386543  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  93.8 
 
 
581 aa  1077    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  75.09 
 
 
644 aa  817    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  96.39 
 
 
580 aa  1112    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3724  cytochrome c oxidase, subunit I  78.39 
 
 
602 aa  897    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2143  cytochrome-c oxidase  69.76 
 
 
665 aa  758    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0607375  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  79.9 
 
 
596 aa  959    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1901  cytochrome c oxidase, subunit I  67.66 
 
 
559 aa  735    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0984776  normal  0.277007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2216  cytochrome-c oxidase  72.39 
 
 
575 aa  806    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00587232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  79.37 
 
 
594 aa  932    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  78.89 
 
 
589 aa  903    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  93.98 
 
 
581 aa  1076    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  70.48 
 
 
589 aa  807    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  70.99 
 
 
570 aa  778    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2015  cytochrome c oxidase, subunit I  70.35 
 
 
574 aa  805    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.466392  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  72.56 
 
 
567 aa  811    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  54.99 
 
 
563 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  52.31 
 
 
641 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  51.37 
 
 
641 aa  535  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  52.02 
 
 
615 aa  530  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  50.19 
 
 
566 aa  521  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  48.17 
 
 
620 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  47.99 
 
 
611 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.819255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  47.99 
 
 
620 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4153  cytochrome c oxidase subunit I  47.99 
 
 
611 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4061  cytochrome c oxidase, subunit I  47.99 
 
 
620 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  47.8 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  47.8 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  48.28 
 
 
623 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  47.8 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  47.8 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4045  cytochrome c oxidase, subunit I  47.8 
 
 
620 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.505439  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  48.83 
 
 
638 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  48.15 
 
 
565 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  50.86 
 
 
587 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1776  cytochrome-c oxidase  50.1 
 
 
529 aa  480  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3769  cytochrome c oxidase subunit I type  48.17 
 
 
620 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3522  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  47.65 
 
 
648 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0659  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  47.95 
 
 
654 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  46.98 
 
 
555 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  47.54 
 
 
546 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  46.52 
 
 
559 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  46.99 
 
 
553 aa  475  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  45.21 
 
 
555 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  46.14 
 
 
554 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  50 
 
 
541 aa  476  1e-133  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  47.54 
 
 
546 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  46.25 
 
 
562 aa  475  1e-133  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0184  cytochrome-c oxidase  49.51 
 
 
526 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>