41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2051 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  213  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  66.36 
 
 
110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  61.32 
 
 
110 aa  120  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  52.83 
 
 
277 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  51.4 
 
 
114 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  51.4 
 
 
114 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  51.4 
 
 
114 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  52.29 
 
 
109 aa  110  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.83 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  51.4 
 
 
117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.36 
 
 
111 aa  107  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  47.66 
 
 
130 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  48.18 
 
 
110 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  46.23 
 
 
110 aa  103  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  50.91 
 
 
110 aa  103  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.89 
 
 
132 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.82 
 
 
114 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  48.6 
 
 
111 aa  99.8  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  52.34 
 
 
111 aa  97.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  49.51 
 
 
127 aa  90.1  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  51.46 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  49.37 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  44.86 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  43.69 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  39.33 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  36.45 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  38.03 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0991  hypothetical protein  30.14 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.166279  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  39.39 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  36.19 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  35.71 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0681  hypothetical protein  29.58 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0994  hypothetical protein  35.44 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0782  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0960825  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2019  cupin region  33.33 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.935126  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  31.08 
 
 
87 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>