More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1951 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  85.23 
 
 
421 aa  702    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  86.82 
 
 
423 aa  682    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  86.82 
 
 
423 aa  682    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  86.82 
 
 
423 aa  682    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
440 aa  860    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
435 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  51.94 
 
 
403 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  51.94 
 
 
401 aa  351  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  52.21 
 
 
405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  50.25 
 
 
420 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  47.15 
 
 
434 aa  319  5e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  51.21 
 
 
422 aa  317  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  45.45 
 
 
400 aa  306  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  41.11 
 
 
403 aa  233  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1894  major facilitator transporter  38 
 
 
431 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  27.42 
 
 
387 aa  97.8  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  26.39 
 
 
400 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.86 
 
 
399 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  25.78 
 
 
447 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.86 
 
 
505 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.82 
 
 
506 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.82 
 
 
400 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.82 
 
 
400 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.04 
 
 
474 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
406 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.82 
 
 
400 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
404 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.76 
 
 
400 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.18 
 
 
395 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2055  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.74 
 
 
482 aa  87.8  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.58 
 
 
506 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
395 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 
406 aa  87  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.94 
 
 
400 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
390 aa  84  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3232  major facilitator transporter  28.92 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.904986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
424 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.4 
 
 
641 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.05 
 
 
513 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.05 
 
 
513 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.29 
 
 
513 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.29 
 
 
513 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.05 
 
 
513 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  24.05 
 
 
513 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  24.05 
 
 
513 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  26.17 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.87 
 
 
511 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  27.7 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.7 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4204  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.05 
 
 
513 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.73 
 
 
486 aa  80.1  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  27.14 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 
477 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.81 
 
 
513 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  24.93 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.15 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.5 
 
 
528 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  29.81 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.81 
 
 
513 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.82 
 
 
537 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.72 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  28.72 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.38 
 
 
532 aa  79  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.31 
 
 
523 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1289  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.64 
 
 
529 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.433628  normal  0.278369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.21 
 
 
512 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  28 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  23.53 
 
 
453 aa  77  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25.88 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  26.44 
 
 
467 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  30.36 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
443 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 
537 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  29.33 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7028  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.92 
 
 
539 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1670  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
438 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.7 
 
 
510 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2907  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.36 
 
 
489 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  31.33 
 
 
511 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.43 
 
 
494 aa  74.7  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.83 
 
 
539 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.51 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  29.93 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.97 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  28.04 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.47 
 
 
494 aa  74.3  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 
511 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.64 
 
 
512 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  25.3 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>