103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1901 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
187 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  75.94 
 
 
187 aa  263  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  59.04 
 
 
211 aa  221  5e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  59.04 
 
 
188 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  59.04 
 
 
192 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
211 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
211 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 
211 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  41.3 
 
 
191 aa  127  9e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 
207 aa  85.5  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  30.41 
 
 
189 aa  82.4  4e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
180 aa  80.9  9e-15  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
194 aa  80.5  1e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
207 aa  80.5  1e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 
185 aa  80.1  2e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
215 aa  79  3e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
214 aa  79  4e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
199 aa  79  4e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  34.38 
 
 
202 aa  76.3  2e-13  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
187 aa  76.6  2e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
205 aa  76.3  3e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
180 aa  75.5  4e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
209 aa  75.1  5e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
186 aa  74.7  8e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 
182 aa  74.3  9e-13  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  39.66 
 
 
208 aa  74.3  1e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 
217 aa  73.2  2e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 
217 aa  73.2  2e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
231 aa  72.4  3e-12  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  34.44 
 
 
182 aa  72.4  4e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 
210 aa  71.6  6e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 
205 aa  71.6  6e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.84066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 
188 aa  70.9  1e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 
179 aa  70.5  1e-11  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 
199 aa  69.7  2e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
205 aa  68.2  7e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
205 aa  68.2  7e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 
205 aa  67.8  9e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 
202 aa  67.4  1e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 
209 aa  67  1e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
192 aa  67.8  1e-10  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  6.20531e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
207 aa  65.5  5e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
207 aa  65.5  5e-10  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 
209 aa  65.1  6e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
204 aa  62.8  3e-09  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 
184 aa  62.8  3e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 
209 aa  62.8  3e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 
197 aa  62.8  3e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  33.73 
 
 
212 aa  62.8  3e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
188 aa  62  5e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 
187 aa  61.2  8e-09  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  27.27 
 
 
198 aa  60.8  1e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
188 aa  60.8  1e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  36.28 
 
 
238 aa  59.3  3e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
238 aa  59.3  3e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
238 aa  59.3  3e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 
238 aa  59.3  3e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  36.28 
 
 
238 aa  59.3  3e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  36.28 
 
 
238 aa  59.3  3e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
207 aa  58.9  4e-08  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 
177 aa  55.5  4e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 
224 aa  54.3  9e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
188 aa  52.8  3e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
186 aa  51.6  7e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  34.13 
 
 
215 aa  51.2  9e-06  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
212 aa  50.4  1e-05  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 
177 aa  50.8  1e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
212 aa  49.7  3e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 
184 aa  49.7  3e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
202 aa  47.8  9e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 
206 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 
213 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  20.9 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
212 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
212 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
186 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
211 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  33.33 
 
 
198 aa  44.7  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
212 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
238 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
225 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
246 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 
196 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
225 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
196 aa  42  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  40 
 
 
203 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0944  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
123 aa  41.6  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.335834  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
210 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
210 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
212 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
196 aa  41.2  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
186 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
210 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444335 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>