More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1859 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1859  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4511  isochorismatase hydrolase  78.21 
 
 
185 aa  289  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  66.85 
 
 
179 aa  254  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  66.85 
 
 
179 aa  254  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  66.85 
 
 
179 aa  254  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  53.11 
 
 
179 aa  186  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  50.88 
 
 
187 aa  171  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1908  isochorismatase hydrolase  36.72 
 
 
205 aa  114  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.460102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2142  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  30.68 
 
 
179 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2002  isochorismatase hydrolase  37.13 
 
 
202 aa  101  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0995803  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  30.68 
 
 
179 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  30.11 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0918  isochorismatase hydrolase  34.32 
 
 
194 aa  98.2  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.509433  normal  0.0420596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  35.59 
 
 
201 aa  98.2  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  30.11 
 
 
179 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  30.11 
 
 
179 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  30.11 
 
 
179 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0853  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  30.11 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  30.11 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  30.11 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  27.84 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  32.58 
 
 
201 aa  88.6  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3562  isochorismatase hydrolase  32.76 
 
 
177 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 
196 aa  85.1  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  35.39 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  31.32 
 
 
188 aa  73.6  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  29.87 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  28.9 
 
 
204 aa  71.2  0.000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  26.86 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  31.64 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  26.49 
 
 
203 aa  67  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  33.33 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  25.84 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  27.91 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  25.86 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  29.61 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 
214 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 
192 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  27.57 
 
 
207 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.69 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  30.13 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  29.13 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  30.23 
 
 
192 aa  61.2  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 
231 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 
231 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  31.15 
 
 
231 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  31.15 
 
 
230 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  31.15 
 
 
230 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  32.75 
 
 
231 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  42.39 
 
 
248 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2641  isochorismatase hydrolase  29.07 
 
 
195 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2241  isochorismatase family protein  32.35 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.025604  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  28.8 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  42.39 
 
 
248 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  26.8 
 
 
329 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3082  isochorismatase family protein  32.35 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000597737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4851  isochorismatase hydrolase  41.05 
 
 
224 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  24.55 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  28.65 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2083  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 
182 aa  58.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0890304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  42.25 
 
 
235 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  38.55 
 
 
230 aa  58.2  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2817  isochorismatase hydrolase  33.56 
 
 
188 aa  58.2  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369083  hitchhiker  0.00306149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  26.46 
 
 
248 aa  58.2  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.41 
 
 
227 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2104  isochorismatase  34.94 
 
 
102 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.582746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2043  pyrazinamidase  34.94 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00201028  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  32.16 
 
 
231 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2285  isochorismatase family protein  34.94 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.21607e-26 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2628  isochorismatase hydrolase  36.59 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  31.37 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  42.39 
 
 
247 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  31.01 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3941  isochorismatase superfamily hydrolase  32.93 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0786845 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  29.13 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2288  isochorismatase family protein  31.37 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0832099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1896  isochorismatase hydrolase  32.93 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.404618  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  23.21 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3576  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
213 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.360022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 
212 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  26.26 
 
 
264 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  26.97 
 
 
204 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  32.88 
 
 
228 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  36.78 
 
 
237 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6045  N-carbamoylsarcosine amidase  29.38 
 
 
213 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01880  nicotinamidase-like amidase  28.35 
 
 
204 aa  55.5  0.0000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0690  isochorismatase  30.17 
 
 
200 aa  55.1  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0385693  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2041  pyrazinamidase  33.73 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.228157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>