More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1727 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1727  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 
284 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.681532  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4736  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  76.84 
 
 
274 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.377015  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1355  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  72.08 
 
 
287 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00158528  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1319  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  71.73 
 
 
287 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1336  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  71.73 
 
 
287 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13295  dTDP-6-deoxy-L-lyxo-4-hexulose reductase rmlD  65.93 
 
 
304 aa  322  6e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.10261  normal  0.625833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4210  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  52.96 
 
 
302 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0416  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  51.06 
 
 
293 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.128844  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1853  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  49.16 
 
 
319 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.52 
 
 
298 aa  224  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.466634 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1062  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  49.15 
 
 
321 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6346  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  49.31 
 
 
296 aa  221  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.191715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0633  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.36 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06100  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.46 
 
 
313 aa  211  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.127581  normal  0.398775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3679  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.29 
 
 
285 aa  208  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149825  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8192  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.91 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09030  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  47.27 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0104507  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3018  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.44 
 
 
281 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5899  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  46.5 
 
 
321 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2365  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.32 
 
 
280 aa  188  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.304818  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4467  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.5 
 
 
287 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2017  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.58 
 
 
297 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1686  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.57 
 
 
285 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2594  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.38 
 
 
314 aa  186  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2661  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.72 
 
 
291 aa  185  8e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1580  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.35 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2472  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  42.91 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1209  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.49 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3073  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.94 
 
 
282 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.419885  normal  0.223963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.46 
 
 
281 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.27 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3106  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.64 
 
 
278 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1118  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.74 
 
 
284 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000464599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1376  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.56 
 
 
284 aa  182  7e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.580619  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13108  putative dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.36 
 
 
288 aa  180  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1659  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.65 
 
 
277 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2856  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.64 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0978379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1138  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.38 
 
 
284 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131341  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.38 
 
 
284 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2097  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.28 
 
 
280 aa  178  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1299  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.02 
 
 
284 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1125  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.02 
 
 
284 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.110653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1338  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.2 
 
 
284 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.326275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0481  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.01 
 
 
294 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0599  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.01 
 
 
294 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1344  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.52 
 
 
293 aa  177  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5788  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  45.99 
 
 
290 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1112  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.38 
 
 
284 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0345479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0232  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.79 
 
 
270 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0488037  normal  0.41258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2828  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.62 
 
 
291 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4140  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.69 
 
 
287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000198546 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1445  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.73 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2231  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.87 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0492  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.74 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.37943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1509  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.56 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1487  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.06 
 
 
294 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000030027 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1996  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.14 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3917  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.63 
 
 
284 aa  172  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0252378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0940  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.52 
 
 
283 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3053  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.93 
 
 
307 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0478  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.37 
 
 
296 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1779  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.53 
 
 
297 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00243798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3355  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  35.56 
 
 
296 aa  168  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.909711  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1891  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.3 
 
 
286 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.657644  hitchhiker  0.00910437 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0187  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.72 
 
 
270 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2262  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.37 
 
 
294 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2402  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  29.43 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3135  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.59 
 
 
282 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1006  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  43.35 
 
 
299 aa  166  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.530196  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1420  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.59 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2011  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.79 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.73104  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3463  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  36.71 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.585813  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3272  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  39.72 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1561  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.38 
 
 
285 aa  163  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1207  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.61 
 
 
280 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2099  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.97 
 
 
289 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.626697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2763  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.57 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1381  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.6 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.682696  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2048  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  40.14 
 
 
300 aa  162  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3020  dTDP-6-deoxy-l-mannose-dehydrogenase  36.81 
 
 
293 aa  162  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.361116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1750  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.81 
 
 
283 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.963734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0045  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.94 
 
 
288 aa  161  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.478799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4129  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  31.65 
 
 
461 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.00000000841547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2538  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.19 
 
 
291 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4296  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.11 
 
 
298 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.73519  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0515  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  34.27 
 
 
291 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0900  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.55 
 
 
278 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34862e-32 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1063  hypothetical protein  33.57 
 
 
290 aa  160  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2559  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  41.64 
 
 
281 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.742057  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0735  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.54 
 
 
286 aa  160  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.850791  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1444  dTDP-4-keto-L-rhamnose reductase  33.93 
 
 
283 aa  160  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0306  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  30.5 
 
 
283 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3345  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.91 
 
 
278 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1403  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.07 
 
 
288 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00211248 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1054  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  33.69 
 
 
281 aa  159  5e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1270  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.84 
 
 
246 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4071  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  37.84 
 
 
237 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4330  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  44.83 
 
 
298 aa  158  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00990  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  35.89 
 
 
288 aa  158  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1777  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.46 
 
 
297 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>