More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1608 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  297  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  82.35 
 
 		 157 aa  226  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  76.52 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  76.52 
 
 		 150 aa  187  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1242  MarR family transcriptional regulator  76.27 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  42.96 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  36.5 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  42.22 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 161 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  36.3 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  35.14 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  36.26 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  36.26 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.26 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.26 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.26 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.26 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.26 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  36.26 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.16 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.16 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.16 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.16 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.16 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.16 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  32.74 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2905  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.607898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  33.03 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3505  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.54422 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  37.23 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 182 aa  50.8  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 150 aa  50.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  43.37 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>